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GBDT原理与Sklearn源码分析-回归篇

2018-04-01 20:52 597 查看
纯属留档学习，不做它用。

摘要：

本文将非常详细的介绍GBDT（Gradient Boosting Decision Tree）的原理以及Sklearn里面具体是如何实现一个GBDT的。本次内容将分为两篇文章，一篇是GBDT用于回归，一篇是GBDT用于分类任务。虽然两者其实本质是一样的，只是loss function不同，但是分成两篇可以帮助更好的对比理解。
注意：本文前半部分是GBDT原理的一个概述，后半步是sklearn中是如何实现的，以及给出一个具体例子一步步和读者分享整个算法的流程（本文也侧重于这一点）

1.GB原理概述

注意：对原理已经熟知或者不想太多了解者可直接跳过看实践部分，另外在学习GBDT前非常建议读者先看一下李航老师的《统计学习方法》中的8.4.1节。
首先，先解释一下所谓的boosting（提升）。提升方法就是从弱学习算法出发，反复学习，得到一系列的弱分类器（基分类器），然后组合这些弱分类器，构成一个强分类器。大多数的提升方法都是改变训练数据的概率分布（训练数据的权值分布）。
所以，对于提升方法来说，需要解决两个问题：一是每一轮学习中，如何改变训练数据的权值或者概率分布；二是如何将弱分类器组合成一个强分类器。
了解了所谓的boosting后，我们得到上面的两个问题，对于第一个问题，在GBDT中，其实就是通过拟合损失函数的负梯度值在当前模型的值，这里需要注意的，在以前的机器学习算法中，我们都是通过直接拟合真实值，而在GBDT里，我们拟合的目标不再是真实值，而是一个梯度值，当然这个梯度值和真实值有关系，后面部分会说明。
对于第二个问题，GBDT中的基分类器当然是决策树。但是决策树有很多比如C4.5、ID3、CART等等。那么用的是哪种树？在GBDT里，用的是CART（分类与回归树），同时Sklearn里面实现GBDT时用的基分类器也是CART。
为了前后连贯，这里简单介绍一下CART。一般的CART是这样的：用于分类任务时，树的分裂准则采用基尼指数，用于回归任务时，用MSE（均方误差）。
注意：当然在回归任务中，分裂准则也不再局限于用MSE，也可以用MAE，还可以用Friedman_mse（改进型的mse)。
上面提到，CART可以用于回归和分类，那么到底用回归还是分类呢？上面我们已经提到了，GBDT拟合的目标是一个梯度值，这个值当然是一个连续值或者说实值，所以在GBDT里，通通都是回归树。
有了基分类器后，如何将这些基分类器组合起来？boosting方法一般是使用加法模型。
即：fM(x)=∑Mm=1T(x,θm)fM(x)=∑m=1MT(x,θm)
其实利用GB训练强学习器的思路，总结下来就是下面这个过程：



对于算法的第3步：yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x),就是我们上面说的损失函数的负梯度在当前模型的值。
也就是说，我们每一个颗回归树拟合的目标是yi~yi~。
这里这样说可能比较抽象，我们举几个例子：
比如说，损失函数选择使用：
L(yi,F(xi))=(12)∗(yi−F(xi))2L(yi,F(xi))=(12)∗(yi−F(xi))2,那么其负梯度值为：−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]=(yi−F(xi))−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]=(yi−F(xi))，再带入当前模型的值F(x)=Fm−1(x)F(x)=Fm−1(x)。
则有：
yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=(yi−Fm−1(xi))yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=(yi−Fm−1(xi))
所以我们能看到，当损失函数选用Least-square时，每一次拟合的值就是（真实值-当前模型的值）。
比如说，损失函数选择Least-absolute使用：
L(yi,F(xi))=|yi−F(xi)|L(yi,F(xi))=|yi−F(xi)|，其梯度值为：
yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=sign(yi−Fm−1(xi))yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=sign(yi−Fm−1(xi))
其中signsign是符号函数。
比如说，损失函数选择使用logistic loss时：(二分类任务）
L(yi,F(xi))=yilog(pi)+(1−yi)log(1−pi)L(yi,F(xi))=yilog(pi)+(1−yi)log(1−pi)。
其中pi=11+e−F(xi)pi=11+e−F(xi)。
其梯度值为：
yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=yi−11+e−Fm−1(xi)yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=yi−11+e−Fm−1(xi)（这个简单推导过程在下一篇文章有，以及多分类任务采用的loss-function)
对于算法的第4步，在这里先简单提一下，其目的就是为了求一个最优的基分类器。对于不同的基分类器有不同的寻找，比如，对于决策树，寻找一个最优的树的过程其实依靠的就是启发式的分裂准则。
对于算法的第5步，是一个Line search 的过程，具体可以参考Friedman的文章。在GBDT里，通常将这个过程作为Shrinkage，也就是把ρm做为学习率ρm做为学习率，后面实践部分可以看到效果。
对于算法的第6步，求得新的基分类器后，利用加法模型，更新出下一个模型Fm(x)Fm(x)
大家可以发现，对于算法的第1步我没有提到，这是因为，这个需要在讲完第3步才能够说明。算法的第1步是一个初始化的过程。为什么需要初始化？很简单，因为每次在计算负梯度值时需要用到前一个模型Fm−1(xi)Fm−1(xi)预测的值。对于我们训练的第一个模型m=1m=1而言需要有F0(xi)F0(xi)的存在。
那么F0(x)F0(x)初始化为多少？这个取决于loss function的选择，下面给出一般的做法：
当loss function选择MSE时，F0(x)=y¯F0(x)=y¯，y¯y¯为样本真实值的平均值。比如有数据集：



那么F0(x)=y¯=7.306F0(x)=y¯=7.306
当loss function选择MAE时，F0(x)=medianyF0(x)=mediany，也就说用真实值的中位数作为初始值。
当loss function选择logisit loss时，F0(x)=(12)∗log(∑yi∑(1−yi))F0(x)=(12)∗log(∑yi∑(1−yi))
这里需要注意的是，这里就是利用对数几率来初始化，分子∑yi∑yi就是正样本的个数，分母就是负样本的个数。
比如说，对于数据集：



F0(x)=(12)∗log(∑yi∑(1−yi))=(12)∗log(37)F0(x)=(12)∗log(∑yi∑(1−yi))=(12)∗log(37)
另外，再介绍一个Loss function，指数损失。具体表达为：
L(yi,F(xi))=e−yF(xi)L(yi,F(xi))=e−yF(xi)，其负梯度大家可以自己求求，后面有汇总表给大家参考。
其初始化和上面提到Logisit loss的初始化是一样的。

2.GBDT原理-2

上面我们初步介绍一下GB以及其整个流程，但是我们前面介绍的只是GB的思想，也就是说，对于任意的基分类器都可以利用GB的思想训练一个强分类器。而把基分类器选为决策树（DT)时，就是我们常用的GBDT。
那么对于GBDT来说，其训练过程是怎么样的？对于回归任务。
当我们选择的loss function为Least-square。
即L(yi,F(xi))=(12)∗(yi−F(xi))2L(yi,F(xi))=(12)∗(yi−F(xi))2
其伪代码(简化版)：

Algorithm 2:LS_TreeBoost____________________________________F0(x)=y¯Form=1 to M do:       yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=(yi−Fm−1(xi))       {Rjm}J1=J−terminal node tree({y~i,xi}N1)       γjm=avexi∈Rjmyi~       Fm(x)=Fm−1(x)+∑j=1JγjmI(x∈Rjm)Algorithm 2:LS_TreeBoost____________________________________F0(x)=y¯Form=1 to M do:       yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=(yi−Fm−1(xi))       {Rjm}1J=J−terminal node tree({y~i,xi}1N)       γjm=avexi∈Rjmyi~       Fm(x)=Fm−1(x)+∑j=1JγjmI(x∈Rjm)
上面的伪代码中的基本步骤和Algorithm 1的一样。下面分析一下步骤4和步骤5。
对于步骤4：
其想表达的是以{y~i,xi}N1{y~i,xi}1N为训练数据，拟合一颗回归树，最终得到叶子节点的区域。（详细的见下）
对于步骤5：
在步骤4我们得到叶子节点对应的区域，那么叶子节点的取值为多少？也就是这颗树到底输出多少？
在Friedman的论文中有这部分的推导。这里简单总结一下：
叶子节点的取值和所选择的loss function有关。对于不同的Loss function，叶子节点的值也不一样。
首先，记第mm颗树的第jj个叶子节点的值为γjmγjm
比如，选择MSE作为loss function时：
γjm=avexi∈Rjmyi~γjm=avexi∈Rjmyi~，yi~yi~为梯度值。
比如，选择MAE作为Loss function时：
γjm=medianxi∈Rjm(yi−Fm−1(xi))γjm=medianxi∈Rjm(yi−Fm−1(xi))
比如，选择Logistic loss作为Loss function时：
γjm=∑Ni=1yi~∑Ni=1(yi−yi~)∗(1−yi+yi~)γjm=∑i=1Nyi~∑i=1N(yi−yi~)∗(1−yi+yi~)
比如，选择指数损失作为loss function时：
γjm=∑Ni=1(2yi−1)e(−(2yi−1)Fm−1(xi))∑Ni=1e(−(2yi−1)Fm−1(xi))γjm=∑i=1N(2yi−1)e(−(2yi−1)Fm−1(xi))∑i=1Ne(−(2yi−1)Fm−1(xi))。
这些叶子节点的取值推导过程在论文中其实也只是几笔带过，有兴趣的可以深入研究为何。
最后一个步其实就是把前面已经训练的m−1m−1颗树预测的结果加上刚训练好的第mm颗树的预测结果。

3.GBDT实践以及Sklearn源码分析

相信看完上面后还是感觉对GBDT的训练过程有些模糊，下面就以一个数据集出发，一步一步走GBDT的训练过程，并且同时分析Sklearn里面GBDT的源码。
为了方便说明，我们用下面这个很简单的数据。
xixi12345678910
y~iy~i5.565.75.916.46.87.058.98.79.9.05
1. 选择MSE做为建树的分裂准则
2. 选择MSE作为误差函数
3. 树的深度设置为1
根据算法2，第一步我们需要初始化F0(x)F0(x)，因此F0(x)=7.307F0(x)=7.307
拟合第一颗树（m=1m=1）
由公式，可以计算负梯度值：
yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=(yi−Fm−1(xi))yi~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=(yi−Fm−1(xi))
具体结果如下表：
xixi12345678910
y~iy~i-1.747-1.607-1.397-0.907-0.507-0.2571.5931.3931.6931.743
得到梯度值后，下面就是以y~iy~i为目标值进行拟合。
这里简单介绍一下决策树建树的过程：
决策树学习最关键的步骤就是选择最优划分属性，一般而言，随着划分不过程不断的进行，我们希望决策树的分支节点所包含的样本尽可能属于同一类别（方差小）。通常，我们会选择一个准则来评价划分的质量，比如回归树中经常使用的MSE（这种方法属于启发式的）
对于连续值，我们可以穷尽每个值vv，把每个值vv作为一个分裂点(<=v<=v和>v>v),然后计算两个分支的MSEleft、MSErightMSEleft、MSEright。
选择最小的MSEsum=MSEleft+MSErightMSEsum=MSEleft+MSEright的分裂点vv
对于类别型特征，我们有类似的做法，通过==和≠≠来划分。
当选择11作为分裂点时候，MSEleft=0MSEleft=0,MSEright=1.747MSEright=1.747
当选择22作为分裂点时候，MSEleft=0.0049MSEleft=0.0049,MSEright=1.5091MSEright=1.5091
依次，穷尽所有取值。
可以得到当选择66作为分裂点时MSEsum=0.3276MSEsum=0.3276最小。



至此，我们完成了第一颗树的拟合，拟合完之后我们得到了RjmRjm以及、γjm、γjm
具体为：
R11为xi<=6R11为xi<=6，R21为xi>6R21为xi>6、
γ11=(y~1+y~2+y~3+y~4+y~5+y~6)6=−1.0703γ11=(y~1+y~2+y~3+y~4+y~5+y~6)6=−1.0703
γ21=(y~7+y~8+y~9+y~10)4=1.6055γ21=(y~7+y~8+y~9+y~10)4=1.6055
最后更新F1(xi)F1(xi)值，F1(xi)=F0(xi)+∑2j=1γj1I(xi∈Rj1)F1(xi)=F0(xi)+∑j=12γj1I(xi∈Rj1)。
比如更新其中一个样本x1x1的值：
F1(x1)=F0(x1)+∑2j=1γj1I(x1∈Rj1)=7.307−1.0703=6.2367F1(x1)=F0(x1)+∑j=12γj1I(x1∈Rj1)=7.307−1.0703=6.2367。
这里需要注意的是，前面我们提到一个算法步骤是Line search（具体见论文）。在GBDT里，我们通过不会直接把上一个轮的预测值Fm−1(x)Fm−1(x)直接加上∑Jj=1γjmI(xi∈Rjm)∑j=1JγjmI(xi∈Rjm)，而是会在∑Jj=1γjmI(xi∈Rjm)∑j=1JγjmI(xi∈Rjm)乘上一个学习率。可以理解，因为如果每次完全加上（学习率为1）本轮模型的预测值容易导致过拟合。所以通常在GBDT中的做法（也叫Shrinkage)是：
Fm(x)=Fm−1(x)+η∗∑Jj=1γjmI(x∈Rjm)Fm(x)=Fm−1(x)+η∗∑j=1JγjmI(x∈Rjm)。ηη为学习率。所以，当η=0.1η=0.1时，上面的计算结果变为：
F1(x1)=F0(x1)+0.1∗∑2j=1γj1I(x1∈Rj1)=7.307−0.1∗1.0703=7.1997F1(x1)=F0(x1)+0.1∗∑j=12γj1I(x1∈Rj1)=7.307−0.1∗1.0703=7.1997。
至此一轮迭代（第一个颗树拟合）完成，下面开始第二轮迭代（第二颗树拟合）。
拟合第二颗树（m=2m=2)
比如，这里示范计算y~1y~1。
y1~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=(y1−F1(x1))=(5.56−7.19996)=−1.63996667y1~=−[∂L(yi,F(xi))∂F(xi)]F(x)=Fm−1(x)=(y1−F1(x1))=(5.56−7.19996)=−1.63996667
其他由公式计算可以得到下表：
xixi12345678910
y~iy~i-1.63996667-1.49996667-1.28996667-0.79996667-0.39996667-0.149966671.432451.232451.532451.58245
因此，在第二颗树中，拟合的是新的梯度值。下面的过程就是建树->计算叶子节点的值、叶子节点的区间->更新F2(x)F2(x)。所以就不在累述了。
最后得到两个叶子节点值分别为：
γ12=−0.9633γ12=−0.9633
γ22=1.44495γ22=1.44495
最后，我们来看一下如何进行预测。



当只有两颗树的时候，F2(x)F2(x)即为预测的结果。

总结-1

我们先来简单的总结一下。
回头看，其实GBDT的思路是很简单的，每一次用一个回归树来拟合一个梯度值。而这个梯度值就只是损失函数的一阶导数在当前模型的取值。拟合完一颗树之后，需要计算叶子节点的值，而这个值是和损失函数有关的，当然，数学大神们已经为我们计算好常用的一些损失函数的叶子节点取值。最终预测结果其实就是每一颗树的预测结果相加，所以整个过程都非常的好理解。

Sklearn源码分析

下面这一部分是简单分析一下Sklearn中是如何实现GBDT的。GBDT大部分过程的代码都会涉及，但是源码中有一部分是用cython写的，而这一部分在github上面虽然有.pyx程序，但是还是把关键的部分删掉了，比如说split_node（建树的过程）。
所以没有办法呈现一个完整的分析过程，所以下面挑一些代码分析。
Sklearn里面，当loss function选择mse时，计算负梯度值、计算叶子节点的值是在一个叫LeastSquaresError的类里面实现的。
class LeastSquaresError(RegressionLossFunction):
"""Loss function for least squares (LS) estimation.
Terminal regions need not to be updated for least squares. """
def init_estimator(self):
return MeanEstimator()

def __call__(self, y, pred, sample_weight=None):
if sample_weight is None:
return np.mean((y - pred.ravel()) ** 2.0)
else:
return (1.0 / sample_weight.sum() *
np.sum(sample_weight * ((y - pred.ravel()) ** 2.0)))

def negative_gradient(self, y, pred, **kargs):
return y - pred.ravel()

def update_terminal_regions(self, tree, X, y, residual, y_pred,
sample_weight, sample_mask,
learning_rate=1.0, k=0):
"""Least squares does not need to update terminal regions.

But it has to update the predictions.
"""
# update predictions
print ("树节点值",tree.value)
y_pred[:, k] += learning_rate * tree.predict(X).ravel()
def _update_terminal_region(self, tree, terminal_regions, leaf, X, y,
residual, pred, sample_weight):
pass


其中，下面这个方法就是计算负梯度值。
def negative_gradient(self, y, pred, **kargs):
return y - pred.ravel()
1
2
下面这个是用于初始化的：
class MeanEstimator(object):
"""An estimator predicting the mean of the training targets."""
def fit(self, X, y, sample_weight=None):
if sample_weight is None:
self.mean = np.mean(y)
else:
self.mean = np.average(y, weights=sample_weight)

def predict(self, X):
check_is_fitted(self, 'mean')
y = np.empty((X.shape[0], 1), dtype=np.float64)
y.fill(self.mean)
return y
1
2
3
4

可以看到，对于mse，初始化的使用均值。
def fit(self, X, y, sample_weight=None):
if sample_weight is None:
self.mean = np.mean(y)
else:
self.mean = np.average(y, weights=sample_weight)
1
2

下面这个是更新Fm(x)Fm(x)的值：
def update_terminal_regions(self, tree, X, y, residual, y_pred,
sample_weight, sample_mask,
learning_rate=1.0, k=0):
"""Least squares does not need to update terminal regions.

But it has to update the predictions.
"""
# update predictions
y_pred[:, k] += learning_rate * tree.predict(X).ravel()
1

注意到，每次更新的时候会乘上一个learning_rate（学习率）
最后一个核心部分就是建树。
# induce regression tree on residuals
tree = DecisionTreeRegressor(
criterion=self.criterion,
splitter='best',
max_depth=self.max_depth,
min_samples_split=self.min_samples_split,
min_samples_leaf=self.min_samples_leaf,
min_weight_fraction_leaf=self.min_weight_fraction_leaf,
min_impurity_decrease=self.min_impurity_decrease,
min_impurity_split=self.min_impurity_split,
max_features=self.max_features,
max_leaf_nodes=self.max_leaf_nodes,
random_state=random_state,
presort=self.presort)


可以看到利用了一个回归树来拟合梯度值。
上面的这些代码已经涵盖了GBDT的基本思路：
初始化->计算负梯度值->用回归树拟合负梯度值->计算叶子节点值->更新Fm(x)Fm(x)。
对于建树部分的代码貌似还没有开放出来（可能是我没找到），如果读者有的话请分享一下。

总结-2

大致介绍了一下GBDT的原理以及实践过程和在sklearn里面GBDT的核心代码。由于篇幅不想太长，所以把其余想分享的东西留到下一篇文章中。希望对大家理解GBDT有所帮助。
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标签：  GBDT
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