【MPI学习3】MPI并行程序设计模式：不同通信模式MPI并行程序的设计

【MPI学习3】MPI并行程序设计模式：不同通信模式MPI并行程序的设计

转自：http://www.cnblogs.com/xbf9xbf/p/5204167.html

学习了MPI四种通信模式 及其函数用法：
（1）标准通信模式：MPI_SEND
（2）缓存通信模式：MPI_BSEND
（3）同步通信模式：MPI_SSEND
（4）就绪通信模式：MPI_RSEND
四种通信模式的区别都在消息发送端，而消息接收端的操作都是MPI_RECV。
 
1.标准通信模式
原理图如下



标准通信模式由MPI决定是否用缓存。
如果MPI决定缓存将要发出的数据：发送操作不管接受操作是否执行，都可以进行；而且缓存结束后发送操作就可以返回，不需要等待接受操作收到数据
如果MPI决定不缓存将要发送的数据：对于阻塞通信，则要求接受操作执行，并且数据都发送到接受缓冲区了，发送操作才能够返回；对于非阻塞通信，发送操作虽然没有完成，但是发送调用可以正确返回。
 
 
2.缓存通信模式
与标准通信的区别在于需要自己维护程序的缓冲区。
int MPI_Buffer_attach(void *buffer, int size)用于申请缓存
int MPI_Buffer_detach(void **buffer, int *size) 用于释放缓存 这是一个阻塞调用 函数返回表示缓冲区已经被释放
示例代码如下：

1 #include "mpi.h"
2 #include <stdio.h>
3 #include <stdlib.h>
4 #define SIZE 6
5 static int src = 0;
6 static int dest = 1;
7
8 void generate_data(double *, int);
9 void normal_recv(double *, int);
10 void buffered_send(double *, int);
11
12 void generate_data(double *buffer, int buff_size){
13     int i;
14     for (i=0; i<buff_size; i++) buffer[i]=(double)i+1;
15 }
16
17 void normal_recv(double *buffer, int buff_size){
18     int i,j;
19     MPI_Status status;
20     double *b;
21
22     b = buffer;
23
24     MPI_Recv(b,(buff_size-1),MPI_DOUBLE,src,2000,MPI_COMM_WORLD, &status);
25     fprintf(stderr, "standard receive a message of %d data\n", buff_size-1);
26     for(j=0; j<buff_size-1; j++) fprintf(stderr, "buf[%d]=%f\n",j,b[j]);
27
28     b+=buff_size-1;
29     MPI_Recv(b, 1, MPI_DOUBLE, src, 2000, MPI_COMM_WORLD, &status);
30     fprintf(stderr, "standard receive a message of one data\n");
31     fprintf(stderr, "buf[0]=%f\n",*b);
32 }
33
34 void buffered_send(double *buffer, int buff_size){
35     int i,j;
36     void *bbuffer;
37     int size;
38
39     fprintf(stderr, "buffered send message of %d data\n", buff_size-1);
40     for(j=0; j<buff_size-1; j++) fprintf(stderr, "buf[%d]=%f\n",j,buffer[j]);
41     MPI_Bsend(buffer, (buff_size-1), MPI_DOUBLE, dest, 2000, MPI_COMM_WORLD);
42
43     buffer+=buff_size-1;
44     fprintf(stderr, "bufferred send message of one data\n");
45     fprintf(stderr, "buf[0]=%f\n", *buffer);
46     MPI_Bsend(buffer, 1, MPI_DOUBLE, dest, 2000, MPI_COMM_WORLD);
47
48     MPI_Buffer_detach(&buffer, &size);
49     MPI_Buffer_attach(bbuffer, size);
50 }
51
52 int main(int argc, char *argv[])
53 {
54     int rank;
55     double buffer[SIZE], *tmpbuffer, *tmpbuf;
56     int tsize, bsize;
57     char *test = NULL;
58
59     MPI_Init(&argc, &argv);
60     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
61
62     if (rank==src) { // 发送消息进程
63         generate_data(buffer, SIZE);
64         MPI_Pack_size(SIZE, MPI_DOUBLE, MPI_COMM_WORLD, &bsize);
65         tmpbuffer = (double*)malloc(bsize+2*MPI_BSEND_OVERHEAD);
66         if (!tmpbuffer) {
67             MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1);
68         }
69         // 告诉系统MPI_Bsend用到buffer就去tmpbuffer那里去找
70         MPI_Buffer_attach(tmpbuffer, bsize+2*MPI_BSEND_OVERHEAD);
71         buffered_send(buffer, SIZE);
72         MPI_Buffer_detach(&tmpbuf, &tsize);
73         printf("tsize detach from tmpbuf is : %d\n", tsize);
74     }
75     else if (rank==dest) {
76         normal_recv(buffer, SIZE);
77     }
78     else {
79         MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1);
80     }
81     MPI_Finalize();
82 }

代码输出结果是：



总共需要发送5个double类型，每个类型占8个字节；MPI通信其他附属信息占200个字节；因此总共缓冲区的大小的240个字节。
 
3.同步通信模式
同步发送进程的特点是：发送操作可以不依赖接受进程的相应接受操作是否已经启动，但是必须等着接受操作开始执行后才能返回；这意味着一旦同步发送返回后，发送缓冲区中的数据已经全部被系统缓冲区缓存。“发送缓冲区”表示MPI的缓冲区，“系统缓冲区”指的是操作系统的写缓冲区，注意二者的区别。这意味着同步发送缓冲区中的数据可以被释放或重新利用。而标准通信模式（或缓存通信模式）中，在用缓存的模式下，发送操作返回仅仅意味着数据都已经到发送缓冲区中了，数据是否到系统缓冲区不得知。
示例代码如下：

1 #include "mpi.h"
2 #include <stdio.h>
3
4 #define SIZE 10
5
6 static int src = 0;
7 static int dest = 1;
8
9 int main(int argc, char *argv[])
10 {
11     int rank;
12     int act_size = 0;
13     int flag, np, rval, i;
14     int buffer[SIZE];
15     MPI_Status status, status1, status2;
16     int count1, count2;
17     MPI_Init(&argc, &argv);
18     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
19     MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &np);
20
21     if (np!=2) {
22         MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1);
23     }
24     act_size = 5; /*最大消息长度*/
25     if (rank==src) {
26         MPI_Ssend(buffer, act_size, MPI_INT, dest, 1, MPI_COMM_WORLD);
27         fprintf(stderr, "MPI_Ssend %d data,tag=1\n", act_size);
28         act_size = 4;
29         MPI_Ssend(buffer, act_size, MPI_INT, dest, 2, MPI_COMM_WORLD);
30         fprintf(stderr, "MPI_Ssend %d data,tag=2\n", act_size);
31     }
32     else if (rank=dest) {
33         MPI_Recv(buffer, act_size, MPI_INT, src, 1, MPI_COMM_WORLD, &status1);
34         MPI_Recv(buffer, act_size, MPI_INT, src, 2, MPI_COMM_WORLD, &status2);
35         MPI_Get_count(&status1, MPI_INT, &count1);
36         fprintf(stderr, "receive %d data,tag=%d\n",count1, status1.MPI_TAG);
37         MPI_Get_count(&status2, MPI_INT, &count2);
38         fprintf(stderr, "receive %d data,tag=%d\n",count2, status2.MPI_TAG);
39     }
40     MPI_Finalize();
41 }

代码执行结果如下：



如果将33 34行代码互换位置，则程序陷入了deadlock：一方面发送进程中tag=1的MPI_Ssend操作一直处于阻塞状态；另一方面接受进程中的tag=2的MPI_Recv操作处于阻塞状态；两个进程互相等着对方，陷入了死锁。
 
4. 就绪通信模式
与前几种通信模式不同，只有当接受进程的接受操作已经启动时，才可以在发送端启动发送进程。
一种可能的就绪通信模式实现方法如下图：



 
上图保证的目标是①要先于④执行；方法是插入②和③；①一定先于②执行，③一定等②成功后才能执行，③成功后④才能执行。
由此一定保证①先于④执行，就保证了就绪通信。
示例代码如下：
 

1 #include "mpi.h"
2 #include <stdio.h>
3 #include <stdlib.h>
4
5 #define TEST_SIZE 2000
6
7 void test_rsend();
8
9 int main(int argc, char *argv[])
10 {
11     MPI_Init(&argc, &argv);
12     test_rsend();
13     MPI_Finalize();
14 }
15
16 void test_rsend()
17 {
18     int rank, size;
19     int next, prev;
20     int tag;
21     int count;
22     float send_buf[TEST_SIZE], recv_buf[TEST_SIZE];
23     MPI_Status status;
24     MPI_Request request;
25
26     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
27     MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
28
29     if (2!=size) {
30         MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1);
31     }
32     next = rank + 1;
33     if (next >= size) next = 0;
34     prev = rank - 1;
35     if (prev <0) prev = size-1;
36
37     if (0==rank) {
38         fprintf(stderr, " Rsend Test\n");
39     }
40     tag = 1456;
41     count = TEST_SIZE/3;
42     if (0==rank) {
43         MPI_Recv(MPI_BOTTOM,0,MPI_INT,next,tag,MPI_COMM_WORLD, &status);
44         fprintf(stderr, " Process %d post Ready send\n", rank);
45         MPI_Rsend(send_buf,count,MPI_FLOAT,next,tag,MPI_COMM_WORLD);
46     }
47     else {
48         fprintf(stderr, " process %d post a receive call\n", rank);
49         MPI_Irecv(recv_buf, TEST_SIZE, MPI_FLOAT,MPI_ANY_SOURCE,MPI_ANY_TAG,MPI_COMM_WORLD,&request);
50         MPI_Send(MPI_BOTTOM,0,MPI_INT,next,tag,MPI_COMM_WORLD);
51         MPI_Wait(&request, &status);
52         fprintf(stderr, " Process %d Receive Rsend message from %d\n",rank, status.MPI_SOURCE);
53     }
54 }

 
代码执行结果如下：