Illumina Sequence Identifiers 序列标识符 index详解
2017-02-16 19:38
549 查看
大家基本都知道什么是 FASTA 和 FastQ 格式了,但这是不够的。
我们还需要了解世界上最大的测序公司自己定制的 FastQ 格式,因为你可能会经常用到,有时还会亲自去处理它们。
本文主题:Illumina 测序数据中的 Index
Fastq格式详解
ILLUMINA SEQUENCE IDENTIFIERS
HWUSI-EAS100R:the unique instrument name
6:flowcell lane
73:tile number within the flowcell lane
941:‘x’-coordinate of the cluster within the tile
1973:‘y’-coordinate of the cluster within the tile
#0:index number for a multiplexed sample (0 for no indexing)
/1:the member of a pair, /1 or /2 (paired-end or mate-pair reads only)
有了index就可以同时在一个lane中测多种数据了,后期可以根据index将数据分开。
我们还需要了解世界上最大的测序公司自己定制的 FastQ 格式,因为你可能会经常用到,有时还会亲自去处理它们。
本文主题:Illumina 测序数据中的 Index
Fastq格式详解
@FCHCGKFBCXY:1:1101:1110:2162#AACAGCACCTAGCA_GTAGTGCG/1 ATGTATACTATTGTATGTGAAATGGATCACCAGTCCAGGTTCAACGCCCGAGACAGGGTGCTCAGGGCTGGTGCACTGGATGACCCTGAGGGACGGGATG + cccccggegghgbgggggdfgdegfhggggdgfdgghdgggghfghhhhhghhgggdgdgghhhhghhhgghfhghdPcdgPc_dfghbdgfghhhhhgg @FCHCGKFBCXY:1:1101:1077:2164#NNNNNNNNNNNNNN_NNNNNNNN/1 TGCTGAGCATCAGATCAACCTGATTAAGGTTGATGACAACAAGAAACTAGGGGAATGGGTAGGCCTCTGTAAAANNGANANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN + ccccchhhhhhhhghhgfgghhhhhhhghhhhhhhhhhhhghhhgghghhhhgghgd_gggghhgghghhhghhBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
ILLUMINA SEQUENCE IDENTIFIERS
@HWUSI-EAS100R:6:73:941:1973#0/1
HWUSI-EAS100R:the unique instrument name
6:flowcell lane
73:tile number within the flowcell lane
941:‘x’-coordinate of the cluster within the tile
1973:‘y’-coordinate of the cluster within the tile
#0:index number for a multiplexed sample (0 for no indexing)
/1:the member of a pair, /1 or /2 (paired-end or mate-pair reads only)
有了index就可以同时在一个lane中测多种数据了,后期可以根据index将数据分开。
相关文章推荐
- Python - 序列(sequence) 详解 及 代码
- 【H.264/AVC视频编解码技术详解】 九、序列参数集Sequence Paramater Set(SPS)解析
- Oracle数据库中序列(SEQUENCE)的用法详解
- Oracle数据库中序列(SEQUENCE)的用法详解
- 20180331:Oracle中的视图(view)、索引(index)、约束(constraint)、序列(sequence)
- Pandas详解七之DatetimeIndex、PeriodIndex和TimedeltaIndex时间序列
- Python - 序列(sequence) 详解 及 代码
- Oracle中序列(Sequence)详解
- Oracle中序列(Sequence)详解
- Oracle序列(sequence)详解
- 转--Oracle数据库中序列(SEQUENCE)的用法详解
- Oracle序列的(Sequence)使用
- SQL Server CHARINDEX和PATINDEX详解
- indexOf,lastIndexOf和substring 用法详解
- SQL Server CHARINDEX和PATINDEX详解
- ORACLE PL/SQL 中序列(sequence)的简易使用方法介绍 - [Oracle SQL]
- 工作流模式详解之流程控制模式(1)——Sequence
- oracle-序列(SEQUENCE)
- ORACLE 序列 Sequence
- oracle-序列(SEQUENCE)-