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Mongodb如何使用wiredTiger？

2016-12-02 09:05 519 查看
MongoDB 3.0支持用户自定义存储引擎，用户可配置使用mmapv1或者wiredTiger存储引擎，本文主要介绍Mongodb是如何使用wiredTiger数据库作为底层的数据存储层。目前还没有读过wiredTiger的源码，本文的内容都是基于wiredTiger官方文档，以及Mongodb对wiredTiger封装代码，有问题请指出。


wiredTiger引擎存储布局

wiredTiger（简称WT）支持行存储、列存储以及LSM等3种存储形式，Mongodb使用时，只是将其作为普通的KV存储引擎来使用，mongodb的每个集合对应一个WT的table，table里包含多个Key-value pairs，以B树形式存储。

以下是一个典型的使用WT存储引擎的数据目录布局（配置了directoryPerDB选项，启用了journal）
$tree
.
├── admin
│   ├── collection-11--5764503550749656746.wt
│   ├── collection-14--6907424972913303461.wt
│   ├── collection-16--6907424972913303461.wt
│   ├── collection-20--6907424972913303461.wt
│   ├── collection-8--6907424972913303461.wt
│   ├── collection-9--5764503550749656746.wt
│   ├── index-10--5764503550749656746.wt
│   ├── index-12--5764503550749656746.wt
│   ├── index-13--5764503550749656746.wt
│   ├── index-15--6907424972913303461.wt
│   ├── index-17--6907424972913303461.wt
│   └── index-9--6907424972913303461.wt
├── journal
│   ├── WiredTigerLog.0000000003
│   └── WiredTigerPreplog.0000000001
├── local
│   ├── collection-0--5764503550749656746.wt
│   ├── collection-2--5764503550749656746.wt
│   ├── collection-4--5764503550749656746.wt
│   ├── collection-6--5764503550749656746.wt
│   ├── collection-7--5764503550749656746.wt
│   ├── index-1--5764503550749656746.wt
│   ├── index-3--5764503550749656746.wt
│   ├── index-5--5764503550749656746.wt
│   └── index-8--5764503550749656746.wt
├── _mdb_catalog.wt
├── mongod.lock
├── products
│   ├── collection-6--6907424972913303461.wt
│   └── index-7--6907424972913303461.wt
├── sizeStorer.wt
├── storage.bson
├── WiredTiger
├── WiredTiger.basecfg
├── WiredTiger.lock
├── WiredTiger.turtle
└── WiredTiger.wt


WiredTiger*等文件存储WT的一些配置信息。

local、journal、admin、products等每个目录代表一个DB，DB里包含集合数据及集合的索引数据，每个集合的数据对应一个WT的table（一个.wt后缀的文件），集合的每项索引也对应一个WT的table。

journal目录下存储WT的write ahead log，当服务crash时，可通过log来恢复数据。

_mdb_catalog.wt里存储了所有集合的元数据，包括集合对应的WT table名字，集合的创建选项，集合的索引信息等，WT存储引擎初始化时，会从_mdb_catalog.wt里读取所有的集合信息，并加载元信息到内存。

集合名与WT table名的对应关系可以通过db.collection.stats()获取
mongo-9552:PRIMARY> db.system.users.stats().wiredTiger.uri
statistics:table:admin/collection-10--1436312956560417970


也可以直接dump出_mdb_catalog.wt里的内容查看，dump出的内容为BSON格式，阅读起来不是很方便。
wt -C "extensions=[/usr/local/lib/libwiredtiger_snappy.so]"  -h . dump table:_mdb_catalog


sizeStorer.wt里存储所有集合的容量信息，如文档数、文档总大小等，当插入、删除、更新文档时，这些信息会先cache到内存，没操作1000次会刷盘一次；mongod进程crash可能导致sizeStorer.wt里的数据与实际信息不匹配，可通过validate()命令来重新扫描集合以订正统计信息。


wiredTiger API

WT官方提供了C、Java、Python API，mongodb使用C
API来访问WT数据库，主要包括3个核心的数据结构。
WT_CONNECTION代表一个到WT数据库的连接，通常每个进程只用建立一个连接，WT_CONNECTION的所有方法都是线程安全的。
WT_SESSION代表一个数据库操作的上下文，每个线程需创建独立的session。
WT_CURSOR用于操作某个数据集（如某个table、file），可使用cursor来进行数据库插入、查询操作。

如下是使用wiredTiger C API的示例，展示了如何向WT数据库里插入数据，更多示例参考这里。
#include

char *home = "WT_HOME";

int main(void)
{
WT_CONNECTION *conn;
WT_CURSOR *cursor;
WT_SESSION *session;
const char *key, *value;
int ret;

/* Open a connection to the database */
ret = wiredtiger_open(home, NULL, "create", &conn);

/* Open a session in conn */
ret = conn->open_session(conn, NULL, NULL, &session);

/* Create table if not exist */
ret = session->create(session,
"table:access", "key_format=S,value_format=S");

/* Open a cursor and insert key-value pair */
ret = session->open_cursor(session,
"table:access", NULL, NULL, &cursor);
cursor->set_key(cursor, "key1");
cursor->set_value(cursor, "value1");
ret = cursor->insert(cursor);

/* Close conn */
ret = conn->close(conn, NULL);

return ret;
}


上述示例包含如下步骤
wiredtiger_open()建立连接
conn->open_session建立session
session->create()创建access表，并指定key、value格式
session->open_cursor创建cursor，并插入key-value
访问结束后conn->close()关闭连接


wiredTiger in Mongodb

Mongodb使用wiredTiger作为存储引擎时，直接使用其C API来存储、查询数据。


wiredtiger_open

Mongodb在WiredTigerKVEngine构造的时候wiredtiger_open建立连接，在其析构时关闭连接，其指定的配置参数为：
配置项含义说明
create如果数据库不存在则先创建
cache_size=xxcache大小，使用Mongod cacheSizeGB配置项的值
session_max=20000最大session数量
eviction=(threads_max=4)淘汰线程最大数量，用于将page从cache逐出
statistics=(fast)统计数据采用fast模式
statistics_log=(wait=xx)统计数据采集周期，使用mongod statisticsLogDelaySecs配置项的值
file_manager=(close_idle_time=100000)空闲文件描述符回收时间
checkpoint=(wait=xx,log_size:2G)开启周期性checkpoint，采用Mongod syncPeriodSecs配置项的值
log=(enabled=true,archive=true…启用write ahead log，达到2G时触发checkpoint
重点介绍下checkpoint和log2个配置项，其决定了数据持久化的安全级别；wiredTiger支持2种数据持久化级别，分别是Checkpoint durability 和 Commit-level
durability。

Checkpoint durability

wiredTiger支持对当前的数据集进行checkpoint，checkpoint代表当前数据集的一个快照（或镜像），wiredTiger可配置周期性的进行checkpoint（或当log size达到一定阈值是做checkpoint）。

比如WT配置了周期性checkpoint（没开启log），每5分钟做一次checkpoint，在T1时刻做了一次Checkpoint得到数据集C1，则在接下来的5分钟内，如果服务crash，则WT只能将数据恢复到T1时刻。

Commit-level durability

wiredTiger通过write ahead log来支持commit-level durability。

开启write ahead log后，对WT数据库的更新都会先写log，log的刷盘策略（通过trasaction_sync配置项 或者 begion_transaction参数指定）决定了持久化的级别。

mongodb的使用的持久化级别配置为
checkpoint=(wait=60,log_size=2G)
log=(enabled=true,archive=true,path=journal,compressor=snappy)
begin_transcation(“sync=true”)

具体策略为
每60s做一次checkpoint
开启write ahead log，当log size达到2GB时做checkpoint；并自动删除不需要的log文件。
每次commit_transaction时，调用fsync持久化已经commit的log。

基于上述配置，mongodb可以保证服务crash时，所有已经commit的操作都能通过log恢复。


open_session

mongodb使用session pool来管理WT的session，isolation=snapshot指定隔离级别为snapshot。
conn->open_session(conn, NULL, "isolation=snapshot", &_session);


create table

创建数据集合的参数如下
配置项含义说明
create如果集合不存在则先创建
memory_page_max=10mpage内存最大值
split_pct=90page split百分比
checksum=on开启校验
key_format=q,value_format=ukey为int64_t类型（RecordId），value为WT_ITEM
数据集合的key为int64_t类型的RecordId，RerordId在集合内部唯一，value为二进制的BSON格式。

创建索引集合的参数如下
配置项含义说明
create如果集合不存在则先创建
type=file,internal_page_max=16k,leaf_page_max=16k配置树节点大小
checksum=on开启校验
key_format=u,value_format=ukey-value均为WT_ITEM格式
索引集合的key、value均为二进制数据。

table创建好之后，就可以往table

比如，往某个集合插入一组元素
db.coll.insert({_id: "apple", count: 100});
db.coll.insert({_id: "peach", count: 200});
db.coll.insert({_id: "grape", count: 300});


对应一个coll的数据集合，其对应的WT数据类似于
KEYVALUE
1{_id: “apple”, count: 100}
2{_id: “peach”, count: 200}
3{_id; “grape”, count: 300}
以及基于id的索引集合，其对应的WT数据类似于
KEYVALUE
“apple”1
“peach”2
“grape”3
接下来如果在count上建索引，索引会存储在新的WT table里，数据类似于
db.coll.ensureIndex({count: -1})

KEYVALUE
3003
2002
1001


总结

Mongodb使用wiredTiger存储引擎时，其将wiredTiger作为一个KV数据库来使用，mongodb的集合和索引都对应一个wiredTiger的table。并依赖于wiredTiger提供的checkpoint + write ahead log机制提供高数据可靠性。


转载作者简介

张友东](http://yunnotes.NET)，就职于阿里云飞天技术部，主要关注分布式存储、Nosql等技术领域，参与TFS（淘宝分布式文件系统）、KVStore(Redis云服务)等项目的开发工作，欢迎交流。



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