Linux中使用Moduler切换MPI环境方法步骤详解

本文主要和大家分享在linux系统中，使用Moduler切换各种MPI环境的方法步骤，希望可以帮助大家更好的学习linux相关知识，一起来看看吧。

　　安装不同版本的mpi库

　　sudo yum install -y openmpi-1.10.x86_64 openmpi-1.10-devel.x86_64sudo yum install -y openmpi-1.8.x86_64 openmpi-1.8-devel.x86_64sudo yum install -y mpich2.x86_64 mpich2-devel.x86_64

　　安装modules

　　sudo yum install -y environment-modules

　　使用module管理库

　　使用 module avail 查看当前可用的库

　　$ module avail

　　--------------------------------- /usr/share/Modules/modulefiles ----------------------------------

　　dot module-git module-info modules null use.own

　　---------------------------------------- /etc/modulefiles -----------------------------------------

　　mpich-x86_64 openmpi-1.10-x86_64 openmpi-1.8-x86_64 openmpi-x86_64

　　使用 module list 查看当前已经加载的库

　　$ module list

　　# 如果已经使用 module load 加载了库，查看结果如下：

　　$ module load openmpi-1.10-x86_64

　　$ module list

　　Currently Loaded Modulefiles:

　　1) openmpi-1.10-x86_64

　　使用 module load/unload 加载和卸载库

　　$ module load openmpi-1.10-x86_64

　　$ module list

　　Currently Loaded Modulefiles:

　　1) openmpi-1.10-x86_64

　　$ module unload openmpi-1.10-x86_64

　　添加自定义模块

　　从 “module avail” 命令结果可以看到在 /etc/modulefiles 目录下保存着各个mpi的配置信息，下面是openmpi-1.10-x86_64的配置内容。

#%Module 1.0

#

#  OpenMPI module for use with 'environment-modules' package:

#

conflict        mpi

prepend-path        PATH        /usr/lib64/openmpi-1.10/bin

prepend-path        LD_LIBRARY_PATH /usr/lib64/openmpi-1.10/lib

prepend-path        PYTHONPATH  /usr/lib64/python2.6/site-packages/openmpi-1.10

prepend-path        MANPATH     /usr/share/man/openmpi-1.10-x86_64

setenv          MPI_BIN     /usr/lib64/openmpi-1.10/bin

setenv          MPI_SYSCONFIG   /etc/openmpi-1.10-x86_64

setenv          MPI_FORTRAN_MOD_DIR /usr/lib64/gfortran/modules/openmpi-1.10-x86_64

setenv          MPI_INCLUDE /usr/include/openmpi-1.10-x86_64

setenv          MPI_LIB     /usr/lib64/openmpi-1.10/lib

setenv          MPI_MAN     /usr/share/man/openmpi-1.10-x86_64

setenv          MPI_PYTHON_SITEARCH /usr/lib64/python2.6/site-packages/openmpi-1.10

setenv          MPI_COMPILER    openmpi-x86_64

setenv          MPI_SUFFIX  _openmpi

setenv          MPI_HOME    /usr/lib64/openmpi-1.10

　　因此，对于自己手动安装的mpi版本，可以根据上面的配置来写一个新的版本，比如我新加一个/etc/modulefiles/myopenmpi文件，将其中的路径指定我自己安装的openmpi路径/opt/openmpi上，文件看起来如下：

#%Module 1.0

#

#  OpenMPI module for use with 'environment-modules' package:

#

conflict                mpi

prepend-path            PATH            /opt/openmpi/bin

prepend-path            LD_LIBRARY_PATH /opt/openmpi/lib

prepend-path            PYTHONPATH      /usr/lib64/python2.6/site-packages/openmpi-1.10

prepend-path            MANPATH         /opt/openmpi/share/man

setenv                  MPI_BIN         /opt/openmpi/bin

setenv                  MPI_SYSCONFIG   /etc/myopenmpi-1.10-x86_64

setenv                  MPI_FORTRAN_MOD_DIR     /usr/lib64/gfortran/modules/openmpi-1.10-x86_64

setenv                  MPI_INCLUDE     /opt/openmpi/include

setenv                  MPI_LIB         /opt/openmpi/lib

setenv                  MPI_MAN         /opt/openmpi/share/man

setenv                  MPI_PYTHON_SITEARCH     /usr/lib64/python2.6/site-packages/openmpi-1.10

setenv                  MPI_COMPILER    openmpi-x86_64

setenv                  MPI_SUFFIX      _openmpi

setenv                  MPI_HOME        /opt/openmpi

 

然后就可以在 “module avail” 中看到这个新添加的版本了。

 

文章来源：Kongxx's Blog