Ubuntu安装磁共振处理软件Fsl步骤
2016-04-01 15:26
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在Ubuntu上Fsl的安装步骤并不复杂,但官网FslWiki是英文网页,而且有许多文件链接,所以,Fsl安装起来略显困难。我尝试了很多次,终于安装成功。一些经验,愿拿出来分享。Fsl安装方式有多种,网上也有多种方式的介绍,在这里简单介绍一下我的方法。
安装之前,首先要在虚拟机(推荐VMware)上装好Ubuntu系统(推荐12.0以上版本),考虑到以后要进行磁共振数据处理,建议预留给他硬盘空间大于60G,最好是空出一个盘专门放Ubuntu系统。我当时吃了预设硬盘空间不足的亏,所以希望安装时能注意一下。进入Ubuntu,打开终端(Ctrl+Alt+t),固定到左侧选项栏。Ubuntu指令不多说了,开始介绍Fsl安装步骤。
注意:安装Fsl之前,先打开Ubuntu的Updater进行更新。然后进行下面的步骤。
1、Fsl 网站
打开链接。
http://neuro.debian.net/install_pkg.html?p=fsl-complete
2、选择服务器
打开之后会出现如下选项:
![](https://img-blog.csdn.net/20160401154841282?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQv/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center)
选择应用的系统和下载服务器,并点击“only”。右侧下拉菜单中,三个China开头的都可以选。我的选择如下:
![](https://img-blog.csdn.net/20160401155054986?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQv/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center)
3、
在终端中输入下面指令:
wget -O- http://neuro.debian.net/lists/trusty.cn-bj1.libre | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
注意:这里有时会出现卡顿,很长时间没有反应。情况如下:
![](https://img-blog.csdn.net/20160401160018864?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQv/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center)
我的解决方法是,多次按回车,直到终端开始提示你输密码(这个方法有点暴力,希望还能找到别的方法)。之后出现服务器信息如下:
![](https://img-blog.csdn.net/20160401182756627?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQv/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center)
4、
在终端中输入下面指令:
sudo apt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://pgp.mit.edu:80 0xA5D32F012649A5A9
5、update
在终端中输入下面指令:
sudo apt-get update
6、安装Fsl
在终端中输入下面指令:
sudo apt-get install fsl
注意:官网原指令是“sudo apt-get install fsl-complete”,我安装时提示找不到安装包,这句指令可能有错。
7、配置环境变量
在终端输入sudo gedit /etc/bash.bashrc,在所打开的文本的最后加入
. /etc/fsl/fsl.sh
保存打开文件,并关闭。
注意:
a.“ . /”中“.”和“/”之间有空格。
b.路径填写要查看fsl.sh的所在路径。如下图所示:
![](https://img-blog.csdn.net/20160403214850359?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQv/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center)
————————————————————————————————————
安装步骤结束,在终端中输入“Fsl”就可以开了软件了。
![](https://img-blog.csdn.net/20160401184525368?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQv/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center)
(PS:这只咸鱼长得好丑!)
安装之前,首先要在虚拟机(推荐VMware)上装好Ubuntu系统(推荐12.0以上版本),考虑到以后要进行磁共振数据处理,建议预留给他硬盘空间大于60G,最好是空出一个盘专门放Ubuntu系统。我当时吃了预设硬盘空间不足的亏,所以希望安装时能注意一下。进入Ubuntu,打开终端(Ctrl+Alt+t),固定到左侧选项栏。Ubuntu指令不多说了,开始介绍Fsl安装步骤。
注意:安装Fsl之前,先打开Ubuntu的Updater进行更新。然后进行下面的步骤。
1、Fsl 网站
打开链接。
http://neuro.debian.net/install_pkg.html?p=fsl-complete
2、选择服务器
打开之后会出现如下选项:
选择应用的系统和下载服务器,并点击“only”。右侧下拉菜单中,三个China开头的都可以选。我的选择如下:
3、
在终端中输入下面指令:
wget -O- http://neuro.debian.net/lists/trusty.cn-bj1.libre | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
注意:这里有时会出现卡顿,很长时间没有反应。情况如下:
我的解决方法是,多次按回车,直到终端开始提示你输密码(这个方法有点暴力,希望还能找到别的方法)。之后出现服务器信息如下:
4、
在终端中输入下面指令:
sudo apt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://pgp.mit.edu:80 0xA5D32F012649A5A9
5、update
在终端中输入下面指令:
sudo apt-get update
6、安装Fsl
在终端中输入下面指令:
sudo apt-get install fsl
注意:官网原指令是“sudo apt-get install fsl-complete”,我安装时提示找不到安装包,这句指令可能有错。
7、配置环境变量
在终端输入sudo gedit /etc/bash.bashrc,在所打开的文本的最后加入
. /etc/fsl/fsl.sh
保存打开文件,并关闭。
注意:
a.“ . /”中“.”和“/”之间有空格。
b.路径填写要查看fsl.sh的所在路径。如下图所示:
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安装步骤结束,在终端中输入“Fsl”就可以开了软件了。
(PS:这只咸鱼长得好丑!)
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