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Adam学习8之数据获取

2016-03-07 11:20 253 查看

Adam学习8之数据获取：

例如：NA21144和NA12878

ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/data_collections/1000_genomes_project/data/GIH/NA21144

ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/data_collections/1000_genomes_project/data/CEU/NA12878

原来是在/vol1/ftp/data下，如：
ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/data/NA21144/alignment/NA21144.chrom11.ILLUMINA.bwa.GIH.low_coverage.20130415.bam
现在切换到了/vol1/ftp/data_collections/1000_genomes_project/data/下，具体说明请见/vol1/ftp/data下的说明文件：README_data_has_moved.md，window下可使用MarkdownPad2.exe

还未对NA12878.alt_bwamem_GRCh38DH.20150718.CEU.low_coverage.cram等文件进行解压，不知道是否可以得到上诉文件？？

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标签： adam scala spark

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