Spark Executor在YARN上的内存分配

一个Executor对应一个JVM进程。
从Spark的角度看，Executor占用的内存分为两部分：ExecutorMemory和MemoryOverhead

一、ExecutorMemory

ExecutorMemory为JVM进程的Java堆区域。大小通过属性spark.executor.memory设置。也可以在spark-submit命令时用参数--executor-memory设置。

用于缓存RDD数据的memoryStore位于这一区域。

memoryStore占用空间的比例通过属性spark.storage.memoryFraction和spark.storage.safetyFraction控制

相关源码：

//core/src/main/scala/org/apache/spark/storage/BlockManager.scala
/** Return the total amount of storage memory available. */
private def getMaxMemory(conf: SparkConf): Long = {
val memoryFraction = conf.getDouble("spark.storage.memoryFraction", 0.6)
val safetyFraction = conf.getDouble("spark.storage.safetyFraction", 0.9)
(Runtime.getRuntime.maxMemory * memoryFraction * safetyFraction).toLong
}

所以，一个Executor用于存储RDD的空间=(ExecutorMemory–
MEMORY_USED_BY_RUNTIME) * spark.storage.memoryFraction *spark.storage.safetyFraction

二、MemoryOverhead
MemoryOverhead是JVM进程中除Java堆以外占用的空间大小，包括方法区（永久代）、Java虚拟机栈、本地方法栈、JVM进程本身所用的内存、直接内存（Direct
Memory）等。通过spark.yarn.executor.memoryOverhead设置，单位MB。
相关源码：

//yarn/common/src/main/scala/org/apache/spark/deploy/yarn/YarnSparkHadoopUtil.scala
val MEMORY_OVERHEAD_FACTOR = 0.07
val MEMORY_OVERHEAD_MIN = 384

//yarn/common/src/main/scala/org/apache/spark/deploy/yarn/YarnAllocator.scala
protected val memoryOverhead: Int = sparkConf.getInt("spark.yarn.executor.memoryOverhead",
math.max((MEMORY_OVERHEAD_FACTOR * executorMemory).toInt, MEMORY_OVERHEAD_MIN))
......
val totalExecutorMemory = executorMemory + memoryOverhead
numPendingAllocate.addAndGet(missing)
logInfo(s"Will allocate $missing executor containers, each with $totalExecutorMemory MB " +
s"memory including $memoryOverhead MB overhead")

三、相关问题

如果用于存储RDD的空间不足，先存储的RDD的分区会被后存储的覆盖。当需要使用丢失分区的数据时，丢失的数据会被重新计算
如果Java堆或者永久代的内存不足，则会产生各种OOM异常，executor会被结束。spark会重新申请一个container运行executor。失败executor上的任务和存储的数据会在其他executor上重新计算。
如果实际运行过程中ExecutorMemory+MemoryOverhead之和（JVM进程总内存）超过container的容量。YARN会直接杀死container。executor日志中不会有异常记录。spark同样会重新申请container运行executor。

在Java堆以外的JVM进程内存占用较多的情况下，应该将MemoryOverhead设置为一个足够大的值，应该将MemoryOverhead设置为一个足够大的值，以防JVM进程因实际占用的内存超标而被kill。如果默认值（math.max((MEMORY_OVERHEAD_FACTOR
*executorMemory).toInt,MEMORY_OVERHEAD_MIN）不够大，可以通过spark.yarn.executor.memoryOverhead手动设置一个更大的值。

参考资料：
http://www.wdong.org/wordpress/blog/2015/01/08/spark-on-yarn-where-have-all-my-memory-gone/
http://stackoverflow.com/questions/28404714/yarn-why-doesnt-task-go-out-of-heap-space-but-container-gets-killed