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动态规划(一)——最长公共子序列和最长公共子串

2015-08-29 16:25 429 查看
注:

最长公共子序列采用动态规划解决,由于子问题重叠,故采用数组缓存结果,保存最佳取值方向。输出结果时,则自顶向下建立二叉树,自底向上输出,则这过程中没有分叉路,结果唯一。 最长公共子串采用参考串方式,逐步比对,若相同则对应参考值自增,同时记录当前时刻最大参考值,及其位置。最后输出多组结果。

源码:lcs.cpp

#include "stdafx.h"
#include <stdio.h>
#include <vector>

/************************************************************************/
/* 最长公共子序列 / 最长公共子串                                        */
/*     lcseq      /     lcstr                                           */
/************************************************************************/

//注意!需要输出多组结果!

int length(char *pstr)
{
int i;
i = 0;
while (*pstr++) i++;
return i;
}

void print_matrix(int **mat, char *x, char *y, int m0, int n0, int m, int n)
{
int i, j;
printf("    ");
for (j = 0; j < n; j++)
{
printf("%-3c", y[j]);
}
printf("\n");
for (i = m0; i < m; i++)
{
printf("%-4c", x[i - m0]);
for (j = n0; j < n; j++)
{
printf("%-3d", mat[i][j]);
}
printf("\n");
}
}

/*
* > 子串是串的一个连续的部分
* > 子序列则是不改变序列的顺序,而从序列中去掉任意的元素而获得新的序列
* > 【也就是说,子串中字符的位置必须是连续的,子序列则可以不必连续。】
*/

struct node
{
int parent;
char c;
};

//************************************
// Method:    构建二叉树
// FullName:  build_btree
// Access:    public
// Returns:   void
// Qualifier:
// Parameter: char * x 原始字符串X
// Parameter: int * * mat 跟踪矩阵
// Parameter: int m 串X长度
// Parameter: int n 串Y长度
// Parameter: int parent 父结点ID
// Parameter: std::stack<node> & tree 树
//************************************
void build_btree(char *x, int **mat, int m, int n, int parent, std::vector<node>& tree)
{
if (m == -1 || n == -1)//跟踪到叶子结点,可以打印
{
int i;
for (i = parent; i != -1; i = tree[i].parent)
{
char c;
c = tree[i].c;
if (c)
{
printf("%c", c);
}
}
printf("\n");
return;
}
if (m == 0 && n == 0)//处理左上角结点的情况Z(0,0)
{
build_btree(x, mat, -1, -1, parent, tree);
return;
}
int p = mat[m]
;
if (mat[m]
== 0)//防止访问重复结点
return;
mat[m]
= 0;
node newnode;
newnode.c = '\0';
newnode.parent = parent;
tree.push_back(newnode);
parent = tree.size() - 1;
switch (p)
{
case 1://左上,相同
tree.back().c = x[m];
build_btree(x, mat, m, n - 1, parent, tree);
break;
case 2://上
build_btree(x, mat, m - 1, n, parent, tree);
break;
case 3://左
build_btree(x, mat, m, n - 1, parent, tree);
break;
case 4://左和上
build_btree(x, mat, m, n - 1, parent, tree);
build_btree(x, mat, m - 1, n, parent, tree);
break;
default:
break;
}
}

//************************************
// Method:    最长公共子序列(DP动态规划)
// FullName:  lcseq
// Access:    public
// Returns:   void
// Qualifier:
// Parameter: char * x
// Parameter: char * y
//************************************
void lcseq(char *x, char *y)
{
//串x:X[ 0 .. m-1 ] x.length=m
//串y:Y[ 0 .. n-1 ] y.length=n
//串z:Z[ 0 .. k-1 ] z.length=k, z = lcseq(x,y)

//【z是x与y的最长公共子序列】
//
//================ 递推方法 ================
//从最后一位看起:
//
// >>> 第一种情况:
// *     若X[last]==Y[last],则z[last]=X[last]=Y[last]
// *     则lcseq(x,y) = lcseq(x-1,y-1) + (x[last] or y[last])
//
// >>> 第二种情况:
// *     若X[last]<>Y[last],考虑:
// *     1) 若Z[last]==X[last],则lcseq(x,y) = lcseq(x,y-1)
// *     2) 若Z[last]==Y[last],则lcseq(x,y) = lcseq(x-1,y)
// *     3) 否则,lcseq(x,y) = max_length{lcseq(x,y-1), lcseq(x-1,y)}
// *     综合得lcseq(x,y) = max_length{lcseq(x,y-1), lcseq(x-1,y)}
//
//图表展示:
//     ┏━━━━━━━┳━━━━━━━┓
//     ┃  Z(i-1,j-1)  ┃   Z(i-1,j)   ┃
//     ┣━━━━━━━╋━━━━━━━┫
//     ┃  Z(i,j-1)    ┃   Z(i,j)     ┃
//     ┗━━━━━━━┻━━━━━━━┛
//
//================ 总结递推公式 ================
//     【已知Z(i-1,j-1)、Z(i-1,j)、Z(i,j-1),求Z(i,j)】
//     初始:
//     1) Z(0,0)=0
//     2) Z(0,~)=0
//     3) Z(~,0)=0
//     递推:
//     1) X[i] == Y[j] ==> Z(i,j) = Z(i-1,j-1) + 1
//     2) X[i] <> Y[j] ==> Z(i,j) = max{Z(x,y-1), Z(x-1,y)}
//
//================ 跟踪输出所有LCS ================
//由Z(m,n)可以向左上方遍历,所过所有路径即形成二叉树
//故考虑建立二叉树,实行自叶子向根部的遍历

int m, n, i, j;
int **zmat, *zmat0;
int **pmat, *pmat0;
std::vector<node> tree;//保存二叉树的数组(栈式存储)
//计算长度
m = length(x);
n = length(y);
//建立保存Z(i,j)函数值的二维数组,定义域为{(i,j)|i in [0..m] and j in [0..n]}
zmat = new int*[m + 1];//指针数组
zmat0 = new int[(m + 1) * (n + 1)];//m+1行n+1列,一维数组建立
for (i = 0; i <= m; i++) zmat[i] = &zmat0[i * (n+1)];
for (i = 0; i <= m; i++) zmat[i][0] = 0;//i行0列置0
for (j = 1; j <= n; j++) zmat[0][j] = 0;//0行j列置0
//建立跟踪数组,跟踪Z(i,j)的取值方向(第一种情况为左上角取值,第二种情况为上边或左边取值)
pmat = new int*[m];//指针数组
pmat0 = new int[m * n];//m行n列,一维数组建立
for (i = 0; i < m; i++) pmat[i] = &pmat0[i * n];
//填充剩余的Z数组
for (i = 1; i <= m; i++)
{
for (j = 1; j <= n; j++)//注意i,j范围
{
if (x[i - 1] == y[j - 1])//X[i] == Y[j] ==> Z(i,j) = Z(i-1,j-1) + 1
{
zmat[i][j] = zmat[i - 1][j - 1] + 1;
pmat[i - 1][j - 1] = 1;//左上角取值路线
}
else//X[i] <> Y[j] ==> Z(i,j) = max{Z(x,y-1), Z(x-1,y)}
{
int sub;
sub = zmat[i - 1][j] - zmat[i][j - 1];
if (sub >= 0)
{
zmat[i][j] = zmat[i - 1][j];
pmat[i - 1][j - 1] = sub == 0 ? 4 : 2;//左或上取值路线
}
else
{
zmat[i][j] = zmat[i][j - 1];
pmat[i - 1][j - 1] = 3;//左边取值路线
}
}
}
}
printf("Z matrix\n");
print_matrix(zmat, x, y, 1, 1, m + 1, n + 1);
printf("Trace matrix\n");
print_matrix(pmat, x, y, 0, 0, m, n);

//跟踪开始
node root;
root.parent = -1;
root.c = '\0';
tree.push_back(root);
printf("------------- Result -------------\n");
build_btree(x, pmat, m - 1, n - 1, 0, tree);
//清理工作
delete[] zmat;
delete[] zmat0;
delete[] pmat;
delete[] pmat0;
}

//************************************
// Method:    最长公共子串(DP动态规划)
// FullName:  lcstr
// Access:    public
// Returns:   void
// Qualifier:
// Parameter: char * x
// Parameter: char * y
//************************************
void lcstr(char *x, char *y)
{
//以Y作参考串,建立参考数组Z,然后遍历X
//即:对所有i,存在j,使X[i]==Y[j],则Z'[j]=Z[j]+1
//跟踪Z中最大值
int i, j, m, n, *z, max;
std::vector<int> str_indexes;//记录符合要求的lcstr起始位置(可能有多个)
m = length(x);
n = length(y);//Y作参考串
z = new int[n + 1];
for (j = 0; j <= n; j++) z[j] = 0;//初始化
max = 0;
printf("    ");
for (j = 0; j < n; j++)
{
printf("%-3c", y[j]);
}
printf("\n");
for (i = 0; i < m; i++)
{
char c;
c = x[i];
printf("%-4c", c);
for (j = n - 1; j >= 0; j--)
{
if (c == y[j])
{
z[j + 1] = z[j] + 1;
int zj = z[j + 1];
if (zj > max)
{
max = zj;
str_indexes.clear();
}
if (zj == max)
{
str_indexes.push_back(j - zj);
}
}
else
{
z[j + 1] = 0;
}
}
for (j = 1; j <= n; j++)
{
printf("%-3d", z[j]);
}
printf("\n");
}
printf("------------- Result -------------\n");
for (auto& v : str_indexes)
{
for (j = v; j < max + v; j++)
{
printf("%c", y[j]);
}
printf("\n");
}
delete[] z;
}

int main(int argc, char* argv[])
{
char *str1 = "BADCDCBA";
char *str2 = "ABCDCDAB";
printf("a: %s\n", str1);
printf("b: %s\n", str2);
printf("========= lcseq ==========\n");
lcseq(str1, str2);
printf("\n");
printf("========= lcstr ==========\n");
lcstr(str1, str2);
printf("\n");
return 0;
}
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