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Java实现HEAPSORT堆排序算法

2014-09-17 00:00 579 查看
Section 1 – 简介

Heapsort是一个comparison-based的排序算法(快排,归并,插入都是;counting sort不是),也是一种选择排序算法(selection sort),一个选择算法(selection algorithm)的定义是找到一个序列的k-th order statistic(统计学中的术语),直白的说就是找到一个list中第k-th小的元素。以上都可以大不用懂,heapsort都理解了回来看一下是这回事就是了。同样,插值排序也是一种选择排序算法。

Heapsort的时间复杂度在worst-case是O(nlgn),average-case是O(nlgn);空间复杂度在worst-case是O(1),也就是说heapsort可以in-place实现;heapsort不稳定。

以下顺便附上几种排序算法的时间复杂度比较(Θ−notation比O−notation更准确的定义了渐进分析(asymptotic analysis)的上下界限,详细了解可以自行google):
Table 1 – 四种排序算法的running time比较
Algorithm
Worst-case
Average-case/expected
Insertion sort(插值排序)
 Θ(n2)
 Θ(n2)
Merge sort(归并排序)
 Θ(nlgn)
 Θ(nlgn)
Heapsort(堆排序)
 O(nlgn)
 O(nlgn)
Quicksort(快速排序)
 Θ(n2)
 Θ(n2) (expected)
*Additional Part – KNN

heapsort在实践中的表现经常不如quicksort(尽管quicksort最差表现为 Θ(n2),但quicksort 99%情况下的runtime complexity为 Θ(nlgn)),但heapsort的O(nlgn)的上限以及固定的空间使用经常被运作在嵌入式系统。在搜索或机器学习中经常也有重要的作用,它可以只返回k个排序需要的值而不管其他元素的值。例如KNN(K-nearest-neighbour)中只需返回K个最小值即可满足需求而并不用对全局进行排序。当然,也可以使用divide-and-conquer的思想找最大/小的K个值,这是一个题外话,以后有机会做一个专题比较下。

以下程序为一个简单的在python中调用heapq进行heapsort取得k个最小值,可以大概体现上面所述的特性:

”’

Created On 15-09-2014
@author: Jetpie

”’

import heapq, time

import scipy.spatial.distance as spd

import numpy as np
pool_size = 100000

#generate an 3-d random array of size 10,000

# data = np.array([[2,3,2],[3,2,1],[2,1,3],[2,3,2]])

data = np.random.random_sample((pool_size,3))

#generate a random input

input = np.random.random_sample()

#calculate the distance list

dist_list = [spd.euclidean(input,datum) for datum in data]
#find k nearest neighbours

k = 10
#use heapsort

start = time.time()

heap_sorted = heapq.nsmallest(k, range(len(dist_list)), key = lambda x: dist_list[x])

print(‘Elasped time for heapsort to return %s smallest: %s’%(k,(time.time() – start)))
#find k nearest neighbours

k = 10000
#use heapsort

start = time.time()

heap_sorted = heapq.nsmallest(k, range(len(dist_list)), key = lambda x: dist_list[x])

print(‘Elasped time for heapsort to return %s smallest: %s’%(k,(time.time() – start)))
get_k_smallest

运行结果为:
Elasped time for heapsort to return 10 smallest: 0.0350000858307
Elasped time for heapsort to return 10000 smallest: 0.0899999141693


Section 2 – 算法过程理解

2.1 二叉堆

   


在“堆排序”中的“堆”通常指“二叉堆(binary heap)”,许多不正规的说法说“二叉堆”其实就是一个完全二叉树(complete binary tree),这个说法正确但不准确。但在这基础上理解“二叉堆”就非常的容易了,二叉堆主要满足以下两项属性(properties):

#1 – Shape Property: 它是一个完全二叉树。

#2 – Heap Property: 主要分为max-heap property和min-heap property(这就是我以前说过的术语,很重要)

|–max-heap property :对于所有除了根节点(root)的节点 i,A[Parent]≥A[i]

  |–min-heap property :对于所有除了根节点(root)的节点 i,A[Parent]≤A[i]

上图中的两个二叉树结构均是完全二叉树,但右边的才是满足max-heap property的二叉堆。

在以下的描述中,为了方便,我们还是用堆来说heapsort中用到的二叉堆。

2.2 一个初步的构想

有了这样一个看似简单的结构,我们可以产生以下初步构想来对数组A做排序:

1.将A构建成一个最大堆(符合max-heap property,也就是根节点最大);

2.取出根节点(how?);

3.将剩下的数组元素在建成一个最大二叉堆,返回第2步,直到所有元素都被取光。

如果已经想到了以上这些,那么就差不多把heapsort完成了,剩下的就是怎么术语以及有逻辑、程序化的表达这个算法了。

2.3 有逻辑、程序化的表达

通常,heapsort使用的是最大堆(max-heap)。给一个数组A(我们使用 Java序列[0...n]),我们按顺序将它初始化成一个堆:

Input: 




Initialization:

 


*堆的根节点(root)为A[0];

对这个堆中index为i的节点,我们可以得到它的parent, left child and right child,有以下操作:

Parent(i): parent(i)←A[floor((i−1)/2)]

Left(i): left(i)←A[2∗i+1]

Right(i): right(i)←A[2∗i+2]

通过以上操作,我们可以在任意index-i得到与其相关的其他节点(parent/child)。

在heapsort中,还有三个非常重要的基础操作(basic procedures):

Max-Heapify(A , i): 维持堆的#2 - Heap Property,别忘了在heapsort中我们指的是max-heap property(min-heap property通常是用来实现priority heap的,我们稍后提及)。

Build-Max-Heap(A): 顾名思义,构建一个最大堆(max-heap)。

Heapsort(A): 在Build-Max-Heap(A)的基础上实现我们2.2构想中得第2-3步。

其实这三个操作每一个都是后面操作的一部分。

下面我们对这三个非常关键的步骤进行详细的解释。

Max-Heapify(A , i)

+Max-Heapify的输入是当前的堆A和index-i,在实际的in-place实现中,往往需要一个heapsize也就是当前在堆中的元素个数。

+Max-Heapify有一个重要的假设:以Left(i)和Right(i)为根节点的subtree都是最大堆(如果树的知识很好这里就很好理解了,但为什么这么假设呢?在Build-Max-Heap的部分会解释)。

+有了以上的输入以及假设,那么只要对A[i], A[Left(i)]和A[Right(i)]进行比较,那么会产生两种情况:

-第一种,最大值(largest)是A[i],那么基于之前的重要假设,以i为根节点的树就已经符合#2 - Heap Property了。

-第二种,最大值(largest)是A[Left(i)]或A[Right(i)],那么交换A[i]与A[largest],这样的结果是以largest为根节点的subtree有可能打破了#2 - Heap Property,那么对以largest为根节点的树进行Max-Heapify(A, largest)的操作。

+以上所述的操作有一个形象的描述叫做A[i] “float down”, 使以i为根节点的树是符合#2 - Heap Property的,以下的图例为A[0] ”float down”的过程(注意,以A[1]和A[2]为根节点的树均是最大堆)。

  

  

  


以下附上reference[1]中的Psudocode:

MAX-HEAPIFY(A, i)

l = LEFT(i)

r = RIGHT(i)

if <= heapsize and A[l] > A[i]

largest = l

else largest = i

if r <= heapsize and A[r] > A[largest]

largest = r

if not largest = i

exchange A[i] with a[largest]

MAX-HEAPIFY(A, largest)

Build-Max-Heap(A)

先附上reference[1]中的Psudocode(做了部分修改,这样更明白),因为非常简单:
1 BUILD-MAX-HEAP(A)
2     heapsize = A.length
3     for i = PARENT(A.length-1) downto 0
4         MAX-HEAPIFY(A , i)


+Build-Max-Heap首先找到最后一个有子节点的节点 i=PARENT(A.length−1) 作为初始化(Initialization),因为比 i 大的其他节点都没有子节点了所以都是最大堆。

+对 i 进行降序loop并对每个 i 都进行Max-Heapify的操作。由于比 i 大的节点都进行过Max-Heapify操作而且 i 的子节点一定比 i 大, 因此符合了Max-Heapify的假设(以Left(i)和Right(i)为根节点的subtree都是最大堆)。

下图为对我们的输入进行Build-Max-Heap的过程:

  

  


  

  


Heapsort(A)

到现在为止我们已经完成了2.2中构想的第一步,A[0]也就是root节点是数组中的最大值。如果直接将root节点取出,会破坏堆的结构,heapsort算法使用了一种非常聪明的方法。

+将root节点A[0]和堆中最后一个叶节点(leaf)进行交换,然后取出叶节点。这样,堆中除了以A[0]为root的树破坏了#2 - Heap Property,其他subtree仍然是最大堆。只需对A[0]进行Max-Heapify的操作。

+这个过程中将root节点取出的方法也很简单,只需将heapsize←heapsize−1。

下面是reference[1]中的Psudocode:
1 HEAPSORT(A):
2     BUILD-MAX-HEAP(A)
3     for i = A.length downto 1
4         exchange A[0] with A[i]
5         heapsize =  heapsize -1
6         MAX-HEAPIFY(A , 0)


到此为止就是整个heapsort算法的流程了。注意,如果你是要闭眼睛也能写出一个堆排,最好的方法就是理解以上六个重要的操作。

Section 3 – runtime复杂度分析

这一个section,我们对heapsort算法过程中的操作进行复杂度分析。

首先一个总结:
Max-Heapify ~ O(lgn)
Build-Max-Heap ~ O(n)
Heapsort ~ O(nlgn)

然后我们分析一下为什么是这样的。在以下的分析中,我们所指的所有节点i都是从1开始的。

Max-Heapify 

这个不难推导,堆中任意节点 i 到叶节点的高度(height)是lgn。要专业的推导,可以参考使用master theorem。

Build-Max-Heap

在分析heapsort复杂度的时候,最有趣的就是这一步了。

如果堆的大小为n,那么堆的高度为⌊lgn⌋;

对于任意节点i,i到叶节点的高度是h,那么高度为h的的节点最多有⌈n/2h+1⌉个,下面是一个大概的直观证明:

-首先,一个大小为n的堆的叶节点(leaf)个数为⌈n/2⌉:

–还记不记得最后一个有子节点的节点parent(length – 1)是第⌊n/2⌋(注意这里不是java序号,是第几个),由此可证叶节点的个数为n - ⌊n/2⌋;

-那么如果去掉叶节点,剩下的堆的节点个数为n−⌈n/2⌉=⌊n/2⌋,这个新树去掉叶节点后节点个数为⌊⌊n/2⌋/2⌋ ;

-(这需要好好想一想)以此类推,最后一个树的叶节点个数即为高度为h的节点的个数,一定小于⌈(n/2)/2h⌉,也就是⌈n/2h+1⌉。

对于任意节点i,i到叶节点的高度是h,运行Max-Heapify所需要的时间为O(h),上面证明过。

那么Build-Max-Heap的上限时间为(参考reference[1]):

∑⌊lgn⌋h=0⌈n2h+1⌉O(h)=O(n∑⌊lgn⌋h=0h2h)

根据以下定理:

∑∞k=0kxk=x(1−x)2for|x|<1

我们用x=12替换求和的部分得到:

∑∞h=0h2h=1/2(1−1/2)2=2

综上所述,我们可以求得:

O(n∑⌊lgn⌋h=0h2h)=O(n∑∞h=0h2h)=O(2n)=O(n)

Heapsort

由于Build-Max-Heap复杂度为O(n),有n-1次调用Max-Heapify(复杂度为O(lgn)),所有总的复杂度为O(nlgn)

到此为止,所有functions的运行复杂度都分析完了,下面的章节就是使用Java的实现了。

Section 4 – Java Implementation

这个Section一共有两个内容,一个简单的Java实现(只有对key排序功能)和一个Priority Queue。

Parameters & Constructors:

protected double A[];

protected int heapsize;
//constructors

public MaxHeap(){}

public MaxHeap(double A[]){

buildMaxHeap(A);

}

求parent/left child/right child:
1 protected int parent(int i) {return (i - 1) / 2;}
2 protected int left(int i) {return 2 * i + 1;}
3 protected int right(int i) {return 2 * i + 2;}


保持最大堆特性:

protected void maxHeapify(int i){

int l = left(i);

int r = right(i);

int largest = i;

if (l <= heapsize – 1 && A[l] > A[i])

largest = l;

if (r <= heapsize – 1 && A[r] > A[largest])

largest = r;

if (largest != i) {

double temp = A[i];

// swap

A[i] = A[largest];

A[largest] = temp;

this.maxHeapify(largest);

}

}

构造一个“最大堆”:

public void buildMaxHeap(double [] A){

this.A = A;

this.heapsize = A.length;
for (int i = parent(heapsize – 1); i >= 0; i–)

maxHeapify(i);

}

对一个array使用heapsort:

public void heapsort(double [] A){

buildMaxHeap(A);
int step = 1;

for (int i = A.length – 1; i > 0; i–) {

double temp = A[i];

A[i] = A[0];

A[0] = temp;

heapsize–;

System.out.println(“Step: ” + (step++) + Arrays.toString(A));

maxHeapify(0);

}

}

main函数:

public static void main(String[] args) {

//a sample input

double [] A = {3, 7, 2, 11, 3, 4, 9, 2, 18, 0};

System.out.println(“Input: ” + Arrays.toString(A));

MaxHeap maxhp = new MaxHeap();

maxhp.heapsort(A);

System.out.println(“Output: ” + Arrays.toString(A));
}

运行结果:

Input: [3.0, 7.0, 2.0, 11.0, 3.0, 4.0, 9.0, 2.0, 18.0, 0.0]

Step: 1[0.0, 11.0, 9.0, 7.0, 3.0, 4.0, 2.0, 2.0, 3.0, 18.0]

Step: 2[0.0, 7.0, 9.0, 3.0, 3.0, 4.0, 2.0, 2.0, 11.0, 18.0]

Step: 3[2.0, 7.0, 4.0, 3.0, 3.0, 0.0, 2.0, 9.0, 11.0, 18.0]

Step: 4[2.0, 3.0, 4.0, 2.0, 3.0, 0.0, 7.0, 9.0, 11.0, 18.0]

Step: 5[0.0, 3.0, 2.0, 2.0, 3.0, 4.0, 7.0, 9.0, 11.0, 18.0]

Step: 6[0.0, 3.0, 2.0, 2.0, 3.0, 4.0, 7.0, 9.0, 11.0, 18.0]

Step: 7[0.0, 2.0, 2.0, 3.0, 3.0, 4.0, 7.0, 9.0, 11.0, 18.0]

Step: 8[2.0, 0.0, 2.0, 3.0, 3.0, 4.0, 7.0, 9.0, 11.0, 18.0]

Step: 9[0.0, 2.0, 2.0, 3.0, 3.0, 4.0, 7.0, 9.0, 11.0, 18.0]

Step: 10[0.0, 2.0, 2.0, 3.0, 3.0, 4.0, 7.0, 9.0, 11.0, 18.0]

Output: [0.0, 2.0, 2.0, 3.0, 3.0, 4.0, 7.0, 9.0, 11.0, 18.0]

heapsort在实践中经常被一个实现的很好的快排打败,但heap有另外一个重要的应用,就是Priority Queue。这篇文章只做拓展内容提及,简单得说,一个priority queue就是一组带key的element,通过key来构造堆结构。通常,priority queue使用的是min-heap,例如按时间顺序处理某些应用中的objects。

为了方便,我用Inheritance实现一个priority queue:

package heapsort;

import java.util.Arrays;

public class PriorityQueue extends MaxHeap{

public PriorityQueue(){super();}

public PriorityQueue(double [] A){super(A);}
public double maximum(){

return A[0];

}
public double extractMax(){

if(heapsize<1)

System.err.println(“no element in the heap”);

double max = A[0];

A[0] = A[heapsize-1];

heapsize–;

this.maxHeapify(0);

return max;

}
public void increaseKey(int i,double key){

if(key < A[i])

System.err.println(“new key should be greater than old one”);
A[i] = key;

while(i>0 && A[parent(i)] <A[i]){

double temp = A[i];

A[i] = A[parent(i)];

A[parent(i)] = temp;

i = parent(i);

}

}
public void insert(double key){

heapsize++;

A[heapsize - 1] = Double.MIN_VALUE;

increaseKey(heapsize – 1, key);

}
public static void main(String[] args) {

//a sample input

double [] A = {3, 7, 2, 11, 3, 4, 9, 2, 18, 0};

System.out.println(“Input: ” + Arrays.toString(A));

PriorityQueue pq = new PriorityQueue();

pq.buildMaxHeap(A);

System.out.println(“Output: ” + Arrays.toString(A));

pq.increaseKey(2, 100);

System.out.println(“Output: ” + Arrays.toString(A));

System.out.println(“maximum extracted: ” + pq.extractMax());

pq.insert(33);

System.out.println(“Output: ” + Arrays.toString(A));
}

}
priorityqueue

运行结果:
Input: [3.0, 7.0, 2.0, 11.0, 3.0, 4.0, 9.0, 2.0, 18.0, 0.0]
Output: [18.0, 11.0, 9.0, 7.0, 3.0, 4.0, 2.0, 2.0, 3.0, 0.0]
Output: [100.0, 11.0, 18.0, 7.0, 3.0, 4.0, 2.0, 2.0, 3.0, 0.0]
maximum extracted: 100.0
Output: [33.0, 18.0, 4.0, 7.0, 11.0, 0.0, 2.0, 2.0, 3.0, 3.0]


Section 5 – 小结

首先要说本文全部是原创,如需要使用,只需要引用一下并不需要通知我。

写到最后发现有很多写得很冗余,也有啰嗦的地方。感觉表达出来对自己的知识巩固很有帮助。Heapsort真是一个非常有意思的排序方法,是一个通用而不算复杂的算法,这是决定开始写blogs后的第一篇文章,一定有很多不足,欢迎讨论!之后打算写一些机器学习和计算机视觉方面的来抛砖引玉。希望通过博客园这个平台可以交到更多有钻研精神的朋友。
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