hdu 1080 Human Gene Functions dp
2014-07-30 14:32
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题意:
给定两个基因,对比两个基因的相似度。即给定一个表,行列项均为ACTG-,表示基因,表内数字表示行和列对应基因的相似度,-为空。先给定两个字符串表示基因a和b,长度分别为n和m,我们可以在字符串中间加入-,使得两个字符串长度相同;现在问通过加入-,最大的基因相似度是多少?
题解:
dp题目,dp[i][j]表示用了a串用了前i个字符,b串用了前j个字符的情况下,得到的最大基因值。答案就是dp
[m]。
由于‘-’不能和‘-’配对,所以可以得出dp公式:dp[i][j]=max(dp[i-1][j-1]+get_num(a[i-1],b[j-1]),dp[i-1][j]+get_num(a[i-1,]'-'),dp[i][j-1]+get_num('-',b[j-1]));
代码:
给定两个基因,对比两个基因的相似度。即给定一个表,行列项均为ACTG-,表示基因,表内数字表示行和列对应基因的相似度,-为空。先给定两个字符串表示基因a和b,长度分别为n和m,我们可以在字符串中间加入-,使得两个字符串长度相同;现在问通过加入-,最大的基因相似度是多少?
题解:
dp题目,dp[i][j]表示用了a串用了前i个字符,b串用了前j个字符的情况下,得到的最大基因值。答案就是dp
[m]。
由于‘-’不能和‘-’配对,所以可以得出dp公式:dp[i][j]=max(dp[i-1][j-1]+get_num(a[i-1],b[j-1]),dp[i-1][j]+get_num(a[i-1,]'-'),dp[i][j-1]+get_num('-',b[j-1]));
代码:
#include <iostream> #include <queue> #include <cstdio> #include <cstring> #include <algorithm> #include <ctime> #include <vector> #include <cmath> #include <map> #include <cstdlib> using namespace std; const int maxn=110; int dp[maxn][maxn]; int e[5][5]={ {5,-1,-2,-1,-3}, {-1,5,-3,-2,-4}, {-2,-3,5,-2,-2}, {-1,-2,-2,5,-1}, {-3,-4,-2,-1,-100000}}; map<char,int>mm; char a[maxn],b[maxn]; void init() { mm['A']=0;mm['C']=1;mm['G']=2;mm['T']=3,mm['-']=4; } int get_num(char a,char b) { return e[mm[a]][mm[b]]; } int main() { init(); int T; scanf("%d",&T); while(T--) { int i,j,k,n,m; scanf("%d%s%d%s",&n,a,&m,b); memset(dp,0,sizeof(dp)); for(i=1;i<=n;i++) dp[i][0]=dp[i-1][0]+get_num(a[i-1],'-'); for(i=1;i<=m;i++) dp[0][i]=dp[0][i-1]+get_num('-',b[i-1]); //printf("%s %c\n",a,a[3]); //printf("%d %d\n",get_num('-',b[1]),dp[0][2]); for(i=1;i<=n;i++) { for(j=1;j<=m;j++) { //printf("%d\n",j); dp[i][j]=max(dp[i-1][j]+get_num(a[i-1],'-'),dp[i][j-1]+get_num('-',b[j-1])); dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i-1][j-1]+get_num(a[i-1],b[j-1])); } } printf("%d\n",dp [m]); } return 0; }
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