为什么我把javaweb工程放上了服务器上运行不了的？

最近把微信这个web工程从百度云上的bae上搬回自己的公司上，但是安装环境和验证微信上的URL却花了我两天的时间。当我把服务器弄好后，也配置好了java的运行的环境，一开始我还以为web工程是javaEE，要找javaee的sdk，后来我才知道其实弄这个，都是使用javase的jdk，写这个，是为了帮助那些和我一样的人。
为什么我把javaweb工程放上了服务器上运行部了的？而这个才是我遇到了郁闷了几天的问题，我相信也有和我一样半路出家的同行，而解决这个问题的关键是因为我没有把它部署到tomcat上，要把它部署后，到webapps这个文件夹上拷贝出来，放到自己公司有官网的tomcat上。而我的错误就是自己直接在Workspaces上把整个项目拷贝出来