一种Playfair密码变种加密方法如下：首先选择一个密钥单词（称为pair）（字母不重复，且都为小写字母），然后与字母表中其他字母一起填入至一个5x5的方阵中，填入方法如下1.首先按行填入密钥串。2

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一种Playfair密码变种加密方法如下：首先选择一个密钥单词（称为pair）（字母不重复，且都为小写字母），然后与字母表中其他字母一起填入至一个5x5的方阵中，填入方法如下：
1.首先按行填入密钥串。
2.紧接其后，按字母序按行填入不在密钥串中的字母。
3.由于方阵中只有25个位置，最后剩下的那个字母则不需变换。
如果密钥为youandme，则该方阵如下：
y o u a n
d m e b c
f g h i j
k l p q r
s t v w x
在加密一对字母时，如am，在方阵中找到以这两个字母为顶点的矩形：
o u a
m e b

这对字母的加密字母为该矩形的另一对顶点，如本例中为ob。
请设计程序，使用上述方法对输入串进行加密，并输出加密后的串。
另外有如下规定：
1、一对一对取字母，如果最后只剩下一个字母，则不变换，直接放入加密串中；
2、如果一对字母中的两个字母相同，则不变换，直接放入加密串中；
3、如果一对字母中有一个字母不在正方形中，则不变换，直接放入加密串中；
4、如果字母对出现在方阵中的同一行或同一列，如df或hi，则只需简单对调这两个字母，即变换为fd或ih；
5、如果在正方形中能够找到以字母对为顶点的矩形，假如字母对为am，则该矩形的另一对顶点字母中，
与a同行的字母应在前面，在上例中应是ob；同样若待变换的字母对为ta，则变换后的字母对应为wo；
6、本程序中输入串均为小写字母，并不含标点、空格或其它字符。
解密方法与加密相同，即对加密后的字符串再加密，将得到原始串。
要求输入形式如下：
从控制台输入两行字符串，第一行为密钥单词（长度小于等于25），第二行为待加密字符串（长度小于等于50），
两行字符串末尾都有一个回车换行符，并且两行字符串均为小写字母，不含其它字符。
在标准输出上输出加密后的字符串。
例如，若输入：
youandme
welcometohangzhou
则表示输入的密钥单词为youandme，形成的正方形如上所示；待加密字符串为welcometohangzhou。
在正方形中可以找到以第一对字母we为顶点的矩形，对应另一对顶点字母为vb，因此加密后为vb，
同理可找到与字母对lc,et,oh,ho对应的顶点字母对。而字母对om位于上述正方形中的同一列，所以直接以颠倒这两个字母来加密，即为mo，
字母对an同理。字母对gz中的z不在上述正方形中，因此原样放到加密串中。最后剩一个字母u也原样输出。
因此输出的结果为：
vbrmmomvugnagzguu

*/
import java.util.ArrayList;
import java.util.List;
import java.util.Scanner;

public class 矩阵变换加密法 {
static char[][] cArr = new char[5][5];
static List clist = new ArrayList();

public static void main(String[] args) {
String s = new Scanner(System.in).nextLine();

for (char c = 'a'; c <= 'z'; c++) {
clist.add(c);
}
产生密钥(s);

}

private static void 产生密钥(String s) {

char[] c = s.toCharArray();
for (int i = 0; i < c.length; i++) {
clist.remove((Character) c[i]);

}//若clist中包含密钥，去除密钥中的字母。
StringBuffer sb = new StringBuffer();//拼接密钥中的25个字母，最后转换成二维数组
for (int i = 0; i < c.length; i++) {
sb.append(c[i]);
}
for (int i = 0; i < 25 - c.length; i++) {
sb.append(clist.get(i));
}
for(int i = 0;i<5;i++){
for(int j = 0;j<5;j++){
cArr[i][j] = sb.toString().charAt(i*5+j);
}
}//转换为二位数组

for(int i = 0;i<5;i++){
for(int j = 0;j<5;j++){
System.out.print(cArr[i][j]);
}
System.out.println();
}//打印密钥二维数组

System.out.println("请输入要加密的字符串：");
String str = new Scanner(System.in).nextLine();//要加密的字符串
char[][] strArr = strArr =  new char[str.length()/2][2] ;

for(int i = 0 ;i<str.length()/2;i++){
for(int j = 0;j<2;j++){
strArr[i][j] = str.charAt(i*2 + j);
}
}
//将要加密的字符串转换为二维数组

StringBuffer sb2 = new StringBuffer();
for(int i = 0;i<str.length()/2;i++){
char[]  strLine = strArr[i];
char a = strLine[0];
char b = strLine[1];

int x1 = 0;
int y1 = 0;
int x2 = 0;
int y2 = 0;
/////////////////////////
if(sb.toString().contains(a+"")&&sb.toString().contains(b+"")){//如果包含在密钥中
for(int x = 0;x<cArr.length;x++){//
for(int y = 0;y<cArr.length;y++){
if(cArr[x][y]==a){
x1 = x;//取出a和b的坐标
y1 = y;
}

if(cArr[x][y]==b){
x2 = x;
y2 = y;
}
}

}
if(x1!=x2&&y1!=y2){//不在同一行或者同一列

sb2.append(cArr[x1][y2]);
sb2.append(cArr[x2][y1]);
}else if(x1==x2||y1==y2){
sb2.append(b);
sb2.append(a);
}

}else{//包含在其中，并且不在同一行，不在同一列，那也就是说两个字母可能相同，可能在同一行或者同一列
sb2.append(a);
sb2.append(b);
}

//////////////

}
if(str.length()%2!=0){//若为基数，应该加上最后一个字母。因为声明数组strArr的时候长度是strArr[str/2][2]
sb2.append(str.substring(str.length()-1));
}
System.out.println(sb2.toString());
}
}

运行结果：
youandme
youan
dmebc
fghij
klpqr
stvwx
请输入要加密的字符串：
welcometohangzhou

vbrmmomvugnagzguu