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经典算法研究系列:六、教你初步了解KMP算法、updated

2013-03-30 22:50 573 查看
教你初步了解KMP算法
 

作者: July 、saturnma、上善若水。     时间; 二零一一年一月一日

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本文参考:数据结构(c语言版) 李云清等编著、算法导论
引言:

在文本编辑中,我们经常要在一段文本中某个特定的位置找出 某个特定的字符或模式。

由此,便产生了字符串的匹配问题。

本文由简单的字符串匹配算法开始,再到KMP算法,由浅入深,教你从头到尾彻底理解KMP算法。
来看算法导论一书上关于此字符串问题的定义:

假设文本是一个长度为n的数组T[1...n],模式是一个长度为m<=n的数组P[1....m]。

进一步假设P和T的元素都是属于有限字母表Σ.中的字符。



依据上图,再来解释下字符串匹配问题。目标是找出所有在文本T=abcabaabcaabac中的模式P=abaa所有出现。

该模式仅在文本中出现了一次,在位移s=3处。位移s=3是有效位移。
 
第一节、简单的字符串匹配算法
简单的字符串匹配算法用一个循环来找出所有有效位移,

该循环对n-m+1个可能的每一个s值检查条件P[1....m]=T[s+1....s+m]。
NAIVE-STRING-MATCHER(T, P)

1 n ← length[T]

2 m ← length[P]

3 for s ← 0 to n - m

4     do if P[1 ‥ m] = T[s + 1 ‥ s + m]          

      //对n-m+1个可能的位移s中的每一个值,比较相应的字符的循环必须执行m次。

5           then print "Pattern occurs with shift" s



简单字符串匹配算法,上图针对文本T=acaabc 和模式P=aab。

上述第4行代码,n-m+1个可能的位移s中的每一个值,比较相应的字符的循环必须执行m次。

所以,在最坏情况下,此简单模式匹配算法的运行时间为O((n-m+1)m)。
 
--------------------------------
下面我再来举个具体例子,并给出一具体运行程序:

对于目的字串target是banananobano,要匹配的字串pattern是nano,的情况,
下面是匹配过程,原理很简单,只要先和target字串的第一个字符比较,

如果相同就比较下一个,如果不同就把pattern右移一下,

之后再从pattern的每一个字符比较,这个算法的运行过程如下图。

//index表示的每n次匹配的情形。



#include<iostream>

#include<string>

using namespace std;

int match(const string& target,const string& pattern)

{

    int target_length = target.size();

    int pattern_length = pattern.size();

    int target_index = 0;

    int pattern_index = 0;

    while(target_index < target_length && pattern_index < pattern_length)

    {

        if(target[target_index]==pattern[pattern_index])

        {

            ++target_index;

            ++pattern_index;

        }

        else

        {

            target_index -= (pattern_index-1); 

            pattern_index = 0;

        }

    }

    if(pattern_index == pattern_length)

    {

        return target_index - pattern_length;

    }

    else

    {

        return -1;

    }

}

int main()

{

    cout<<match("banananobano","nano")<<endl;

    return 0;

}
//运行结果为4。
 
上面的算法进间复杂度是O(pattern_length*target_length),

我们主要把时间浪费在什么地方呢,

观查index =2那一步,我们已经匹配了3个字符,而第4个字符是不匹配的,这时我们已经匹配的字符序列是nan,
此时如果向右移动一位,那么nan最先匹配的字符序列将是an,这肯定是不能匹配的,

之后再右移一位,匹配的是nan最先匹配的序列是n,这是可以匹配的。
如果我们事先知道pattern本身的这些信息就不用每次匹配失败后都把target_index回退回去,

这种回退就浪费了很多不必要的时间,如果能事先计算出pattern本身的这些性质,

那么就可以在失配时直接把pattern移动到下一个可能的位置,

把其中根本不可能匹配的过程省略掉,

如上表所示我们在index=2时失配,此时就可以直接把pattern移动到index=4的状态,

kmp算法就是从此出发。
 
第二节、KMP算法
2.1、 覆盖函数(overlay_function)
覆盖函数所表征的是pattern本身的性质,可以让为其表征的是pattern从左开始的所有连续子串的自我覆盖程度。

比如如下的字串,abaabcaba



由于计数是从0始的,因此覆盖函数的值为0说明有1个匹配,对于从0还是从来开始计数是偏好问题,
具体请自行调整,其中-1表示没有覆盖,那么何为覆盖呢,下面比较数学的来看一下定义,比如对于序列
 

a0a1...aj-1 aj

 

要找到一个k,使它满足

a0a1...ak-1ak=aj-kaj-k+1...aj-1aj

而没有更大的k满足这个条件,就是说要找到尽可能大k,使pattern前k字符与后k字符相匹配,k要尽可能的大,

原因是如果有比较大的k存在,而我们选择较小的满足条件的k,

那么当失配时,我们就会使pattern向右移动的位置变大,而较少的移动位置是存在匹配的,这样我们就会把可能匹配的结果丢失。
比如下面的序列,



在红色部分失配,正确的结果是k=1的情况,把pattern右移4位,如果选择k=0,右移5位则会产生错误。

计算这个overlay函数的方法可以采用递推,可以想象如果对于pattern的前j个字符,如果覆盖函数值为k
a0a1...ak-1ak=aj-kaj-k+1...aj-1aj

则对于pattern的前j+1序列字符,则有如下可能

⑴     pattern[k+1]==pattern[j+1] 此时overlay(j+1)=k+1=overlay(j)+1

⑵     pattern[k+1]≠pattern[j+1] 此时只能在pattern前k+1个子符组所的子串中找到相应的overlay函数,h=overlay(k),如果此时pattern[h+1]==pattern[j+1],则overlay(j+1)=h+1否则重复(2)过程.
 
下面给出一段计算覆盖函数的代码:
#include<iostream>

#include<string>

using namespace std;

void compute_overlay(const string& pattern)

{

    const int pattern_length = pattern.size();

    int *overlay_function = new int[pattern_length];

    int index;

    overlay_function[0] = -1;

    for(int i=1;i<pattern_length;++i)

    {

        index = overlay_function[i-1];

        //store previous fail position k to index;

        

        while(index>=0 && pattern[i]!=pattern[index+1])

        {

            index = overlay_function[index];

        }

        if(pattern[i]==pattern[index+1])

        {

            overlay_function[i] = index + 1;  

        }

        else

        {

            overlay_function[i] = -1;

        }

    }

    for(i=0;i<pattern_length;++i)

    {

        cout<<overlay_function[i]<<endl;

    }

    delete[] overlay_function;

}

int main()

{

    string pattern = "abaabcaba";

    compute_overlay(pattern);

    return 0;

}
 
 
运行结果为:
-1

-1

0

0

1

-1

0

1

2

Press any key to continue
-------------------------------------
 
2.2、kmp算法
     有了覆盖函数,那么实现kmp算法就是很简单的了,我们的原则还是从左向右匹配,但是当失配发生时,我们不用把target_index向回移动,target_index前面已经匹配过的部分在pattern自身就能体现出来,只要动pattern_index就可以了。
当发生在j长度失配时,只要把pattern向右移动j-overlay(j)长度就可以了。
 如果失配时pattern_index==0,相当于pattern第一个字符就不匹配,

这时就应该把target_index加1,向右移动1位就可以了。
 
ok,下图就是KMP算法的过程(红色即是采用KMP算法的执行过程):



 
另一作者saturnman发现,在上述KMP匹配过程图中,index=8和index=11处画错了。还有,anaven也早已发现,index=3处也画错了。非常感谢。但图已无法修改,见谅。
 
KMP 算法可在O(n+m)时间内完成全部的串的模式匹配工作。
 
ok,最后给出KMP算法实现的c++代码:
#include<iostream>

#include<string>

#include<vector>

using namespace std;
int kmp_find(const string& target,const string& pattern)

{

    const int target_length = target.size();

    const int pattern_length = pattern.size();

    int * overlay_value = new int[pattern_length];

    overlay_value[0] = -1;

    int index = 0;

    for(int i=1;i<pattern_length;++i)

    {

        index = overlay_value[i-1];

        while(index>=0 && pattern[index+1]!=pattern[i])

        {

            index  = overlay_value[index];

        }

        if(pattern[index+1]==pattern[i])

        {

            overlay_value[i] = index +1;

        }

        else

        {

            overlay_value[i] = -1;

        }

    }

    //match algorithm start

    int pattern_index = 0;

    int target_index = 0;

    while(pattern_index<pattern_length&&target_index<target_length)

    {

        if(target[target_index]==pattern[pattern_index])

        {

            ++target_index;

            ++pattern_index;

        }

        else if(pattern_index==0)

        {

            ++target_index;

        }

        else

        {

            pattern_index = overlay_value[pattern_index-1]+1;

        }

    }

    if(pattern_index==pattern_length)

    {

        return target_index-pattern_index;

    }

    else

    {

        return -1;

    }

    delete [] overlay_value;

}
int main()

{

    string source = " annbcdanacadsannannabnna";

    string pattern = " annacanna";

    cout<<kmp_find(source,pattern)<<endl;

    return 0;

}

//运行结果为 -1.
 
第三节、kmp算法的来源

    kmp如此精巧,那么它是怎么来的呢,为什么要三个人合力才能想出来。其实就算没有kmp算法,人们在字符匹配中也能找到相同高效的算法。这种算法,最终相当于kmp算法,只是这种算法的出发点不是覆盖函数,不是直接从匹配的内在原理出发,而使用此方法的计算的覆盖函数过程序复杂且不易被理解,但是一但找到这个覆盖函数,那以后使用同一pattern匹配时的效率就和kmp一样了,其实这种算法找到的函数不应叫做覆盖函数,因为在寻找过程中根本没有考虑是否覆盖的问题。
    说了这么半天那么这种方法是什么呢,这种方法是就大名鼎鼎的确定的有限自动机(Deterministic finite state automaton DFA),DFA可识别的文法是3型文法,又叫正规文法或是正则文法,既然可以识别正则文法,那么识别确定的字串肯定不是问题(确定字串是正则式的一个子集)。对于如何构造DFA,是有一个完整的算法,这里不做介绍了。在识别确定的字串时使用DFA实在是大材小用,DFA可以识别更加通用的正则表达式,而用通用的构建DFA的方法来识别确定的字串,那这个overhead就显得太大了。
    kmp算法的可贵之处是从字符匹配的问题本身特点出发,巧妙使用覆盖函数这一表征pattern自身特点的这一概念来快速直接生成识别字串的DFA,因此对于kmp这种算法,理解这种算法高中数学就可以了,但是如果想从无到有设计出这种算法是要求有比较深的数学功底的。
 
第四节、精确字符匹配的常见算法的解析

KMP算法:

KMP就是串匹配算法
运用自动机原理
比如说
我们在S中找P
设P={ababbaaba}
我们将P对自己匹配
下面是求的过程:{依次记下匹配失败的那一位}
[2]ababbaaba
.......ababbaaba[1]
[3]ababbaaba
.........ababbaaba[1]
[4]ababbaaba
.........ababbaaba[2]
[5]ababbaaba
.........ababbaaba[3]
[6]ababbaaba
................ababbaaba[1]
[7]ababbaaba
................ababbaaba[2]
[8]ababbaaba
..................ababbaaba[2]
[9]ababbaaba
..................ababbaaba[3]
 
得到Next数组『0,1,1,2,3,1,2,2,3』
主过程:
[1]i:=1 j:=1
[2]若(j>m)或(i>n)转[4]否则转[3]
[3]若j=0或a[i]=b[j]则【inc(i)inc(j)转[2]】否则【j:=next[j]转2】
[4]若j>m则return(i-m)否则return
-1;
若返回-1表示失败,否则表示在i-m处成功
 

BM算法也是一种快速串匹配算法,KMP算法的主要区别是匹配操作的方向不同。虽然T右移的计算方法却发生了较大的变化。

为方便讨论,T="dist :c->{dist称为滑动距离函数,它给出了正文中可能出现的任意字符在模式中的位置。函数                                                    m – j j为                                   dist(m+1     若c = tm

例如,pattern",则p)a)t)dist(= 2,r)n)BM算法的基本思想是:假设将主串中自位置i + dist(si)位置开始重新进行新一轮的匹配,其效果相当于把模式和主串向右滑过一段距离si),即跳过si)个字符而无需进行比较。

下面是一个S ="T="BM算法可以大大加快串匹配的速度。

下面是KMP算法部分,把调用BM函数便可。

 

#include <iostream>  
using namespace std;  
  
int Dist(char *t,char ch)  
{  
    int len = strlen(t);  
    int i = len - 1;  
    if(ch == t[i])  
        return len;  
    i--;  
    while(i >= 0)  
    {  
        if(ch == t[i])  
            return len - 1 - i;  
        else  
            i--;  
    }  
    return len;  
}  
  
int BM(char *s,char *t)  
{  
    int n = strlen(s);  
    int m = strlen(t);  
    int i = m-1;  
    int j = m-1;  
    while(j>=0 && i<n)  
    {  
        if(s[i] == t[j])  
        {  
            i--;  
            j--;  
        }  
        else  
        {  
            i += Dist(t,s[i]);  
            j = m-1;  
        }  
    }  
    if(j < 0)  
    {  
        return i+1;  
    }  
    return -1;  
}  

 
 

Horspool算法
这个算法是由R.Nigel Horspool在1980年提出的。其滑动思想非常简单,就是从后往前匹配模式串,若在某一位失去匹配,此位对应的文本串字符为c,那就将模式串向右滑动,使模式
串之前最近的c对准这一位,再从新从后往前检查。那如果之前找不到c怎么办?那好极了,直接将整个模式串滑过这一位。
例如:

文本串:abdabaca
模式串:baca

倒数第2位失去匹配,模式串之前又没有d,那模式串就可以整个滑过,变成这样:

文本串:abdabaca
模式串:   baca

发现倒数第1位就失去匹配,之前1位有c,那就向右滑动1位:

文本串:abdabaca
模式串:    baca

实现代码:

#include <iostream>  
#include <vector>  
#include <string>  
#include <cstdlib>  
using namespace std;  
  
int  Horspool_match(const string & S,const string & M,int pos)  
{  
    int  S_len = S.size();  
    int  M_len = M.size();  
    int  Mi = M_len-1,Si= pos+Mi;  //这里的串的第1个元素下标是0  
    if( (S_len-pos) < M_len )  
        return -1;  
    while ( (Mi>-1) && (Si<S_len) )  
    {  
        if (S[Si] == M[Mi])  
        {  
            --Mi;  
            --Si;  
        }  
        else  
        {  
            do  
            {   
                Mi--;   
            }   
            while( (S[Si]!=M[Mi]) || (Mi>-1) );  
            Mi = M_len - 1;  
            Si += M_len - 1;  
        }  
    }  
    if(Si < S_len)      
        return(Si + 1);  
    else                
        return -1;  
}  
  
int main( )  
{  
    string S="abcdefghabcdefghhiijiklmabc";  
    string T="hhiij";  
    int    pos = Horspool_match(S,T,3);  
      
    cout<<"/n"<<pos<<endl;  
    system("pause");  
    return 0;  
}  

  
SUNDAY算法:

BM算法的改进的算法SUNDAY--Boyer-Moore-Horspool-Sunday Aglorithm

BM算法优于KMP

SUNDAY 算法描述:

字符串查找算法中,最著名的两个是KMP算法(Knuth-Morris-Pratt)和BM算法(Boyer-Moore)。两个算法在最坏情况下均具有线性的查找时间。但是在实用上,KMP算法并不比最简单的c库函数strstr()快多少,而BM算法则往往比KMP算法快上3-5倍。但是BM算法还不是最快的算法,这里介绍一种比BM算法更快一些的查找算法即Sunday算法。

例如我们要在"substring searching algorithm"查找"search",刚开始时,把子串与文本左边对齐:

substring searching algorithm

search

^
结果在第二个字符处发现不匹配,于是要把子串往后移动。但是该移动多少呢?这就是各种算法各显神通的地方了,最简单的做法是移动一个字符位置;KMP是利用已经匹配部分的信息来移动;BM算法是做反向比较,并根据已经匹配的部分来确定移动量。这里要介绍的方法是看紧跟在当前子串之后的那个字符(上图中的 'i')。

显然,不管移动多少,这个字符是肯定要参加下一步的比较的,也就是说,如果下一步匹配到了,这个字符必须在子串内。所以,可以移动子串,使子串中的最右边的这个字符与它对齐。现在子串'search'中并不存在'i',则说明可以直接跳过一大片,从'i'之后的那个字符开始作下一步的比较,如下图:

substring searching algorithm
 search
^

比较的结果,第一个字符就不匹配,再看子串后面的那个字符,是'r',它在子串中出现在倒数第三位,于是把子串向前移动三位,使两个'r'对齐,如下:

substring searching algorithm
  search
^

哈!这次匹配成功了!回顾整个过程,我们只移动了两次子串就找到了匹配位置,可以证明,用这个算法,每一步的移动量都比BM算法要大,所以肯定比BM算法更快。

#include<iostream>  
#include<fstream>  
#include<vector>  
#include<algorithm>  
#include<string>  
#include<list>  
#include<functional>  
  
using namespace std;  
  
int main()  
{  
    char *text=new char[100];  
    text="substring searching algorithm search";  
    char *patt=new char[10];  
    patt="search";  
    size_t temp[256];  
    size_t *shift=temp;  
      
    size_t patt_size=strlen(patt);  
    cout<<"size : "<<patt_size<<endl;  
    for(size_t i=0;i<256;i++)  
        *(shift+i)=patt_size+1;//所有值赋于7,对这题而言  
      
    for(i=0;i<patt_size;i++)  
        *(shift+unsigned char(*(patt+i) ) )=patt_size-i;  
        /* //       移动3步-->shift['r']=6-3=3;移动三步 
        //shift['s']=6步,shitf['e']=5以此类推 
    */  
      
    size_t text_size=strlen(text);  
    size_t limit=text_size-i+1;  
      
    for(i=0;i<limit;i+=shift[text[i+patt_size] ] )  
        if(text[i]==*patt)  
        {  
        /*       ^13--这个r是位,从0开始算 
        substring searching algorithm 
        search 
        searching-->这个s为第10位,从0开始算 
        如果第一个字节匹配,那么继续匹配剩下的 
            */  
              
            char* match_text=text+i+1;  
            size_t     match_size=1;  
            do{  
                if(match_size==patt_size)  
                      
                    cout<<"the no is "<<i<<endl;  
            }while( (*match_text++)==patt[match_size++] );  
        }  
          
        cout<<endl;     
    }  
    delete []text;  
    delete []patt;    
    return 0;     
}  
  
//运行结果如下:  
/* 
size : 6 
the no is 10 
the no is 30 
Press any key to continue 
*/   

本文完,更多请参考:六(续)、从KMP算法一步一步谈到BM算法
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