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Boyer-Moore(BM)算法学习

2012-09-13 10:15 357 查看

1、概述

在用于查找子字符串的算法当中,BM(Boyer-Moore)算法是目前相当有效又容易理解的一种,一般情况下,比KMP算法快3-5倍。

BM算法在移动模式串的时候是从左到右,而进行比较的时候是从右到左的。

常规的匹配算法移动模式串的时候是从左到右,而进行比较的时候也是是从左到右的,基本框架是:

j = 0;

while(j <= strlen(主串)- strlen(模式串)){

for (i = 0;i < strlen(模式串) && 模式串[i] == 主串[i + j]; ++i)



if (i == strlen(模式串))

Match;

else

++j;

}

而BM算法在移动模式串的时候是从左到右,而进行比较的时候是从右到左的,基本框架是:

j = 0;

while (j <= strlen(主串) - strlen(模式串)) {

for (i = strlen(模式串) - 1; i >= 0 && 模式串[i] ==主串[i + j]; --i)

if (i < 0)

match;

else

++j;

}

显然BM算法并不是上面那个样子,BM算法的精华就在于++j

2、BM算法思想

BM算法实际上包含两个并行的算法,坏字符算法和好后缀算法。这两种算法的目的就是让模式串每次向右移动尽可能大的距离(j+=x,x尽可能的大)。

几个定义:

例主串和模式串如下:

主串 : mahtavaatalomaisema omalomailuun

模式串: maisemaomaloma

好后缀:模式串中的aloma为“好后缀”。

坏字符:主串中的“t”为坏字符。

好后缀算法
如果程序匹配了一个好后缀, 并且在模式中还有另外一个相同的后缀, 那

把下一个后缀移动到当前后缀位置。好后缀算法有两种情况:

Case1:模式串中有子串和好后缀安全匹配,则将最靠右的那个子串移动到好后缀的位置。继续进行匹配。





Case2:如果不存在和好后缀完全匹配的子串,则在好后缀中找到具有如下特征的最长子串,使得P[m-s…m]=P[0…s]。说不清楚的看图。





坏字符算法
当出现一个坏字符时, BM算法向右移动模式串, 让模式串中最靠右的对应字符与坏字符相对,然后继续匹配。坏字符算法也有两种情况。

Case1:模式串中有对应的坏字符时,见图。





Case2:模式串中不存在坏字符。见图。





移动规则
BM算法的移动规则是:

将概述中的++j,换成j+=MAX(shift(好后缀),shift(坏字符)),即

BM算法是每次向右移动模式串的距离是,按照好后缀算法和坏字符算法计算得到的最大值。

shift(好后缀)和shift(坏字符)通过模式串的预处理数组的简单计算得到。好后缀算法的预处理数组是bmGs[],坏字符算法的预处理数组是BmBc[]。

3、代码分析
定义
BM算法子串比较失配时,按坏字符算法计算模式串需要向右移动的距离,要借助BmBc数组。

注意BmBc数组的下标是字符,而不是数字。

BmBc数组的定义,分两种情况。

1、 字符在模式串中有出现。如下图,BmBc[‘k’]表示字符k在模式串中最后一次出现的位置,距离模式串串尾的长度。

2、 字符在模式串中没有出现:,如模式串中没有字符p,则BmBc[‘p’] = strlen(模式串)。





BM算法子串比较失配时,按好后缀算法计算模式串需要向右移动的距离,要借助BmGs数组。

BmGs数组的下标是数字,表示字符在模式串中位置。

BmGs数组的定义,分三种情况。

1、 对应好后缀算法case1:如下图:i是好后缀之前的那个位置。





2、 对应好后缀算法case2:如下图所示:





3、 当都不匹配时,BmGs[i] = strlen(模式串)





在计算BmGc数组时,为提高效率,先计算辅助数组Suff。

Suff数组的定义:suff[i] = 以i为边界, 与模式串后缀匹配的最大长度,即P[i-s...i]=P[m-s…m]如下图:





举例如下:





分析
用Suff[]计算BmGs的方法。

1) BmGs[0…m-1] = m;(第三种情况)

2) 计算第二种情况下的BmGs[]值:

for(i=0;i

if(-1==i || Suff[i] == i+1)

for(;j < m-1-i;++j)

if(suff[j] == m)

BmGs[j] = m-1-i;

3) 计算第三种情况下BmGs[]值,可以覆盖前两种情况下的BmGs[]值:

for(i=0;i

BmGs[m-1-suff[i]] = m-1-i;

如下图所示:





Suff[]数组的计算方法。

常规的方法:如下,很裸很暴力。

Suff[m-1]=m;

for(i=m-2;i>=0;--i){

q=i;

while(q>=0&&P[q]==P[m-1-i+q])

--q;

Suff[i]=i-q;

}

有聪明人想出一种方法,对常规方法进行改进。基本的扫描都是从右向左。改进的地方就是利用了已经计算得到的suff[]值,计算现在正在计算的suff[]值。

如下图所示:

i是当前正准备计算的suff[]值得那个位置。

f是上一个成功进行匹配的起始位置(不是每个位置都能进行成功匹配的, 实际上能够进行成功匹配的位置并不多)。

q是上一次进行成功匹配的失配位置。

如果i在q和f之间,那么一定有P[i]=P[m-1-f+i];并且如果suff[m-1-f+i]=i-q, suff[i]和suff[m-1-f+i]就没有直接关系了。





void preBmBc(char *x, int m, int bmBc[]) {

int i;

for (i = 0; i < ASIZE; ++i)

bmBc[i] = m;

for (i = 0; i < m - 1; ++i)

bmBc[x[i]] = m - i - 1;

}

void suffixes(char *x, int m, int *suff) {

int f, g, i;

f = 0;

suff[m - 1] = m;

g = m - 1;

for (i = m - 2; i >= 0; --i) {

if (i > g && suff[i + m - 1 - f] < i - g)

suff[i] = suff[i + m - 1 - f];

else {

if (i < g)

g = i;

f = i;

while (g >= 0 && x[g] == x[g + m - 1 - f])

--g;

suff[i] = f - g;

}

}

}

void preBmGs(char *x, int m, int bmGs[]) {

int i, j, suff[XSIZE];

suffixes(x, m, suff);

for (i = 0; i < m; ++i)

bmGs[i] = m;

j = 0;

for (i = m - 1; i >= 0; --i)

if (suff[i] == i + 1)

for (; j < m - 1 - i; ++j)

if (bmGs[j] == m)

bmGs[j] = m - 1 - i;

for (i = 0; i <= m - 2; ++i)

bmGs[m - 1 - suff[i]] = m - 1 - i;

}

void BM(char *x, int m, char *y, int n) {

int i, j, bmGs[XSIZE], bmBc[ASIZE];

/* Preprocessing */

preBmGs(x, m, bmGs);

preBmBc(x, m, bmBc);

/* Searching */

j = 0;

while (j <= n - m) {

for (i = m - 1; i >= 0 && x[i] == y[i + j]; --i);

if (i < 0) {

OUTPUT(j);

j += bmGs[0];

}

else

j += MAX(bmGs[i], bmBc[y[i + j]] - m + 1 + i);

}

}




转自http://blog.csdn.net/sealyao/article/details/4568167
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