软件工程专业，大学期间最重要的是学好哪些知识？

我是一名软件工程专业的大二学生，目前为止我们学完的课程有JAVA语言程序设计，JAVA数据结构和算法。JAVA SE 学完了，虽然课本上的编程题我能够完成，自我感觉基础也还好，但是我不知道大家所说的做项目是怎样一个概念，应该如何开始，怎样去发现一个项目，怎样的项目对于提高自身能力是有意义的等等问题。学完JAVA SE之后，大学期间我应该自学JAVA EE吗？还是应该加强算法，数学等“内功”？

我了解到仅仅依靠大学里老师传授的知识是远远不够的，我也很想学习一些课程以外的知识，但是我又怕学习的方向偏了，只是学习到皮毛，导致编程的“内功”没练好。大家能给我一些 建议吗？