如何有效的把业务逻辑和表现形式分离

最近在做一个小型工资计算软件，是为一家小工厂做的。主要是由产量和基价生成工资。
一开始感觉挺简单的；后来和老板交谈，了解需求后，在实际的编写中感觉还是有点复杂的，特别是写完一个模块后，怎么看就怎么感觉不舒服，原因是业务逻辑很难从表现形式中分离出去，而且感觉也没有好好设计就开始动工了。