锋电位分析软件MClust简介
2008-05-02 19:24
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MClust 是一个MATLAB上的锋电位分类工具包,用于四电极胞外记录信号的分类,也可以用于单电极的情况。程序可以直接读入Neuralynx、Axona等记录软件的数据,也可以自己编写程序,读入特定的数据。程序本身只有分类功能,因此读入的数据必须是提取的锋电位,不能是连续记录信号。可以设置PCA、幅度等多种特征提取方法。分类方法有三种,除手动外,还有BubbleClust和KlustaKwik 两种自动聚类方法。另外这个软件的文档也很详细。
打开该软件后,首先设置好特征,以及通道数目,选择数据加载方法,然后选中“Creat/Load FDfiles”,在弹出文件框中选择数据文件。如果没有错误的话,就可以进行聚类了。如果要重新开始分析,或者设置不同的特征,需要先选择“Clearworkspace”,然后再从头来过。
手动聚类界面:
两种自动聚类方法需要借助该软件中的批处理功能,参考说明文档中的“Batch Processing”部分。然后再用MClust对聚类的结果进行二次处理。
打开该软件后,首先设置好特征,以及通道数目,选择数据加载方法,然后选中“Creat/Load FDfiles”,在弹出文件框中选择数据文件。如果没有错误的话,就可以进行聚类了。如果要重新开始分析,或者设置不同的特征,需要先选择“Clearworkspace”,然后再从头来过。
手动聚类界面:
两种自动聚类方法需要借助该软件中的批处理功能,参考说明文档中的“Batch Processing”部分。然后再用MClust对聚类的结果进行二次处理。
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