一个opencv与JAI的图像数据组织问题

最近在使用JNI，设法从Java中调用OpenCV的函数。在OpenCV中图像是以IplImage的形式封装的。IplImage是一个 Header，定义了图像的各种属性，通过查看IplImage结构体我们可以发现，图像数据实际上也是在一段连续的内存中分配的， IplImage.imageData就是指向这块数据的指针。随便访问一个结构体的成员是不好的，所以OpenCV提供了访问原始数据RawData的 方法


void cvGetRawData( const CvArr* arr, uchar** data, int* step=NULL, CvSize* roi_size=NULL );

典型的，对于一个三通道，颜色深度为256的图像img，假设我们知道它的width，height，为了取得其RawData，可以定义一个数组data，并调用cvGetRawData()函数，将RawData存放到data中：
    int raw_data_length = width*height*3；
    byte* data= (byte *)malloc(raw_data_length * sizeof(byte));
    cvGetRawData( img, (uchar**)&data, NULL, NULL );

那么，这个时候，data内部是如何组织的呢？按照一般的逻辑，它应该是这样


｛｛34,123,90｝,{34,122,87},{21,123,88},......｝

按照从左到右，从上到下的顺序，每个像素占三个byte。
如果把这个数据通过JNI传给Java程序，然后再按照上述逻辑重新“组装”成一幅图像，问题就来了。
为了便于调试，我使用了Matlab来“组装”并观察这幅Raw图像(height=13, width=17)：


a=[34,123,90,34,122,





];


m=1;
   for i=1:13


      for j=1:17


           for k=1:3


               if a(m)<0


                  a(m)=
4000
a(m)+256;


               end


               d(i,j,k)=a(m);m=m+1;


           end


      end


end


figure,imshow(uint8(d));





应该是图像RawData的Size，Step之类的错误。

最终我没有找到具体错在那里，但是用下面的代码可以得到正确的数据。

// reconstruct image data     
char *data;
int i, j, step;
CvSize size;    
cvGetRawData( rstImg, (uchar**)&data, &step, &size );
step /= sizeof(data[0]);
int k = 0, offset = 0;
for ( i=0; i<size.height; i++, offset=i*step) {
    for ( j=0; j<size.width; j++ ) {           
        result[k++] = data[offset+2];    
        result[k++] = data[offset+1];
        result[k++] = data[offset];
        offset += 3;
    }
}
注意，Java里面的RGB图像和OpenCV的通道顺序正好是反过来的，即一个是RGB，一个是BGR。
至此，总算可以把OpenCV的图像和Java的图像对应起来了。至于如何在两者之间传递图像数据，请参见@todo: